从基于 GraphQL 的 API 中使用 GET 获取 JSON 不可能吗？

Question

我正在尝试查询 RCSB GraphQL API 以获得有关蛋白质结构的信息。我这样做是作为自动化脚本的一部分。以前我使用他们的搜索 API，但是他们在 12 月退休了。通常使用 httr 总是对我有用，但我觉得在这种情况下我遗漏了一些东西。

他们在其网站 (https://data.rcsb.org/#rest-api) 上建议的第一个示例如下：

https://data.rcsb.org/graphql?query={entry(entry_id:"4HHB"){exptl{method}}}

在浏览器中，我可以很容易地获得所需的信息 (https://data.rcsb.org/graphql?query=%7Bentry(entry_id:%224HHB%22)%7Bexptl%7Bmethod%7D%7D%7D)，但是当我尝试从 R 执行此操作时，我收到客户端错误 400 Bad Request。

library(httr)
query <- 'query={entry(entry_id:"4HHB"){exptl{method}}}'
r <- GET(modify_url("https://data.rcsb.org/graphql", query = query))
http_status(r)

$category
[1] "Client error"

$reason
[1] "Bad Request"

$message
[1] "Client error: (400) Bad Request"

我也尝试了很多不同的东西，但我无法让它以某种方式工作。我对此比较陌生，所以也许有人可以发现一个明显的错误。能得到一些帮助真是太好了！

Answer 1

查询需要URL编码

library(httr)
query <- URLencode('query={entry(entry_id:"4HHB"){exptl{method}}}')
r <- GET(modify_url("https://data.rcsb.org/graphql", query = query))
http_status(r)
#> $category
#> [1] "Success"
#> 
#> $reason
#> [1] "OK"
#> 
#> $message
#> [1] "Success: (200) OK"

从基于 GraphQL 的 API 中使用 GET 获取 JSON 不可能吗？

Fetching JSON with GET from GraphQL-based API not possible?

get

r

httr

graphql