调解 R 包 p 值:获得更多有效数字的解决方法?
Mediation R package p-values: workaround to get more significant digits?
我是运行多重中介分析,需要更正多重比较。然而,调解包提供的 p 值似乎已经四舍五入了,正如@Roland 在这个问题上的非常有用的回答中所观察到的那样:
有没有人找到解决方法来真正为 pvalues 提取更多有效数字?
这些是用 2 位数字打印的,因为这是所有计算方法。这是一项随机分析,因此 p 值只是 50 个(在参考答案中)满足某些条件的模拟的分数。如果你想要更多的数字,你需要将 运行 和 sims
设置为比 50 大得多的值。在你这样做之后,你可以使用相同的技术更改数字设置post,或者更简单的如下:
执行这个:
print.summary.mediate <- 调解:::print.summary.mediate
使用fix(print.summary.mediate)编辑源码,修改行
printCoefmat(smat, digits = 3)
到你想要的任何数字位数。我选了6.
然后运行代码:
data(jobs)
b <- lm(job_seek ~ treat + econ_hard + sex + age, data=jobs)
c <- lm(depress2 ~ treat + job_seek + econ_hard + sex + age, data=jobs)
contcont <- mediate(b, c, sims=1000, treat="treat", mediator="job_seek")
summary(contcont)
我得到了这个输出:
Causal Mediation Analysis
Quasi-Bayesian Confidence Intervals
Estimate 95% CI Lower 95% CI Upper p-value
ACME -0.0166933 -0.0404983 0.00735 0.168
ADE -0.0412011 -0.1278011 0.04465 0.348
Total Effect -0.0578944 -0.1449898 0.02716 0.196
Prop. Mediated 0.2313315 -1.7557486 1.89099 0.288
Sample Size Used: 899
Simulations: 1000
您只能在 p 值上看到 3 位数字,因为这是您通过 1000 次模拟得到的全部结果:n/1000
始终有 3 位数字。如果您选择 sims
不是整数,
你会看到更多的数字:但后面的数字将毫无价值,除了像 123/456 这样的分数没有很好的小数扩展这一事实之外,它们并没有真正表示任何意义。
你的会有所不同,因为它是随机分析。
我是运行多重中介分析,需要更正多重比较。然而,调解包提供的 p 值似乎已经四舍五入了,正如@Roland 在这个问题上的非常有用的回答中所观察到的那样:
有没有人找到解决方法来真正为 pvalues 提取更多有效数字?
这些是用 2 位数字打印的,因为这是所有计算方法。这是一项随机分析,因此 p 值只是 50 个(在参考答案中)满足某些条件的模拟的分数。如果你想要更多的数字,你需要将 运行 和 sims
设置为比 50 大得多的值。在你这样做之后,你可以使用相同的技术更改数字设置post,或者更简单的如下:
执行这个:
print.summary.mediate <- 调解:::print.summary.mediate
使用fix(print.summary.mediate)编辑源码,修改行
printCoefmat(smat, digits = 3)
到你想要的任何数字位数。我选了6.
然后运行代码:
data(jobs)
b <- lm(job_seek ~ treat + econ_hard + sex + age, data=jobs)
c <- lm(depress2 ~ treat + job_seek + econ_hard + sex + age, data=jobs)
contcont <- mediate(b, c, sims=1000, treat="treat", mediator="job_seek")
summary(contcont)
我得到了这个输出:
Causal Mediation Analysis
Quasi-Bayesian Confidence Intervals
Estimate 95% CI Lower 95% CI Upper p-value
ACME -0.0166933 -0.0404983 0.00735 0.168
ADE -0.0412011 -0.1278011 0.04465 0.348
Total Effect -0.0578944 -0.1449898 0.02716 0.196
Prop. Mediated 0.2313315 -1.7557486 1.89099 0.288
Sample Size Used: 899
Simulations: 1000
您只能在 p 值上看到 3 位数字,因为这是您通过 1000 次模拟得到的全部结果:n/1000
始终有 3 位数字。如果您选择 sims
不是整数,
你会看到更多的数字:但后面的数字将毫无价值,除了像 123/456 这样的分数没有很好的小数扩展这一事实之外,它们并没有真正表示任何意义。
你的会有所不同,因为它是随机分析。