在我的 conda 环境中导入 matplotlib 时出现 ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL'
ImportError when importing matplotlib in my conda environment: cannot import name '_imaging' from 'PIL'
我是这个领域的新手，对于可能出现的愚蠢错误深表歉意。
我正在使用 snakemake，所以我按照他们的指示创建了一个 conda 环境：
conda install -c conda-forge mamba
mamba create -c conda-forge -c bioconda -n snakemake snakemake
但是，当我在 运行 基础教程 (enter link description here) 时，发生了 ModuleNotFoundError:
snakemake --cores 1
ModuleNotFoundError: No module named 'matplotlib'
出于这个原因，我用 conda-forge 安装了 matplotlib：
conda install -c conda-forge matplotlib
然而，当我重新运行教程时，我得到了一个 ImportError:
ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL' (/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/init.py)
So I decided to install in the same conda environment also pillow:
conda install -c conda-forge pillow
但是我得到同样的错误运行教程。
所有导入的包都来自我的 conda 环境：
anaconda3/envs/snakemake/lib/python3.9/site-packages
除了从PIL/pillow导入的路径：
usr/lib/python3/dist-packages
我还更新了 conda、anaconda 和我的 snakemake 环境中存在的所有包。此外，我用 conda list 检查了 PIL 的存在，它实际上存在于我的 snakemake 环境中，与其他包的路径相同（anaconda3/envs/snakemake/lib/python3.9/site-packages）。
我注意到在其他问题中建议卸载并重新安装 Pillow。
但是，当我尝试卸载时：
pip uninstall Pillow
和
pip3 uninstall Pillow
我获得：
PermissionError: [Errno 13] Permesso negato: 'BlpImagePlugin.cpython-38.pyc'
因此我尝试强制升级：
pip install -U Pillow --user
和
pip3 install -U Pillow --user
终端显示我已成功安装 Pillow 8.0.1。但是，当我导入 matplotlib 时，出现同样的错误：
ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL' (/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/init.py)
感谢任何提示
谢谢
我猜您错过了教程设置中的一部分 (https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/tutorial/setup.html)。在第 2 步中，您下载 environment.yaml 并使用它来安装所有需要的包。或者您可以尝试自己安装所有软件包，查看“要求”下的列表。
解决了从系统 PIL 包卸载：
sudo apt-get remove python-pil
我仍然不知道它为什么有效，但至少现在我可以正常使用 matplotlib
我是这个领域的新手，对于可能出现的愚蠢错误深表歉意。 我正在使用 snakemake，所以我按照他们的指示创建了一个 conda 环境：
conda install -c conda-forge mamba
mamba create -c conda-forge -c bioconda -n snakemake snakemake
但是，当我在 运行 基础教程 (enter link description here) 时，发生了 ModuleNotFoundError:
snakemake --cores 1
ModuleNotFoundError: No module named 'matplotlib'
出于这个原因，我用 conda-forge 安装了 matplotlib：
conda install -c conda-forge matplotlib
然而，当我重新运行教程时，我得到了一个 ImportError:
ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL' (/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/init.py) So I decided to install in the same conda environment also pillow:
conda install -c conda-forge pillow
但是我得到同样的错误运行教程。
所有导入的包都来自我的 conda 环境：
anaconda3/envs/snakemake/lib/python3.9/site-packages
除了从PIL/pillow导入的路径：
usr/lib/python3/dist-packages
我还更新了 conda、anaconda 和我的 snakemake 环境中存在的所有包。此外，我用 conda list 检查了 PIL 的存在，它实际上存在于我的 snakemake 环境中，与其他包的路径相同（anaconda3/envs/snakemake/lib/python3.9/site-packages）。
我注意到在其他问题中建议卸载并重新安装 Pillow。 但是，当我尝试卸载时：
pip uninstall Pillow
和
pip3 uninstall Pillow
我获得：
PermissionError: [Errno 13] Permesso negato: 'BlpImagePlugin.cpython-38.pyc'
因此我尝试强制升级：
pip install -U Pillow --user
和
pip3 install -U Pillow --user
终端显示我已成功安装 Pillow 8.0.1。但是，当我导入 matplotlib 时，出现同样的错误：
ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL' (/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/init.py)
感谢任何提示 谢谢
我猜您错过了教程设置中的一部分 (https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/tutorial/setup.html)。在第 2 步中，您下载 environment.yaml 并使用它来安装所有需要的包。或者您可以尝试自己安装所有软件包，查看“要求”下的列表。
解决了从系统 PIL 包卸载：
sudo apt-get remove python-pil
我仍然不知道它为什么有效，但至少现在我可以正常使用 matplotlib