Cartopy (0.14.2) / MetPy (0.12.2) 使用 Google Colab 时出现 parse(cf) 错误

Question

我有一个学生在使用旧版本的 MetPy 和 Cartopy 时面临与其他人报告的问题类似的问题。

问题出在 metpy 下的 parse_cf() 命令。它是在 Google Colaboratory 下发生的，我对此经验不多。在其他平台（anaconda、miniconda、自制软件等）上一切正常

我看到的以前的反馈是指从 0.18.* 回滚 cartopy 库的版本。我也遵循了之前发布的有关 Shapely 的指南，但我们似乎无法更改 Google CoLab 中的 cartopy 或 metpy 版本。

环境和 python 库的版本信息，后面是代码和错误。

我在这里不知所措，并尽我所能为我的学生解决了这个问题。我们都将不胜感激。

系统和包信息

MetPy                         0.12.2         
Cartopy                       0.14.2         
3.6.9 (default, Oct  8 2020, 12:12:24) 
[GCC 8.4.0]
Linux d8a71c5140a6 4.19.112+ #1 SMP Thu Jul 23 08:00:38 PDT 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
Linux-4.19.112+-x86_64-with-Ubuntu-18.04-bionic

python-cartopy/bionic,now 0.14.2+dfsg1-2build3 amd64 [installed]
python3-cartopy/bionic,now 0.14.2+dfsg1-2build3 amd64 [installed]

要复制的代码

import numpy as np
import cartopy as c
import metpy as metpy

file_218 = "https://www.ncei.noaa.gov/thredds/dodsC/model-nam218/202011/20201121/nam_218_20201121_0000_000.grb2"

ds218    = xr.open_dataset(file_218)
ds218    = ds218.metpy.parse_cf()

错误信息

---------------------------------------------------------------------------
NameError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-9-4362f5b26659> in <module>()
      9 file_218 = "https://www.ncei.noaa.gov/thredds/dodsC/model-nam218/202011/20201121/nam_218_20201121_0000_000.grb2"
     10 ds218    = xr.open_dataset(file_218)
---> 11 ds218    = ds218.metpy.parse_cf()

1 frames
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/metpy/xarray.py in parse_cf(self, varname, coordinates)
    510         """
    511         from .cbook import iterable
--> 512         from .plots.mapping import CFProjection
    513 
    514         if varname is None:

/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/metpy/plots/__init__.py in <module>()
     17 logger = logging.getLogger(__name__)
     18 
---> 19 __all__ = ctables.__all__[:]  # pylint: disable=undefined-variable
     20 __all__.extend(declarative.__all__)  # pylint: disable=undefined-variable
     21 __all__.extend(skewt.__all__)  # pylint: disable=undefined-variable

NameError: name 'ctables' is not defined

Answer 1

这里的核心问题是 0.14.2 与 MetPy 一起工作太旧了——尽管它崩溃的事实是一个错误，将在即将发布的 1.0 版本中修复。要在 Collab 上安装更新版本的 CartoPy，这个方法对我有用（在单元格中键入这些命令）：

!pip install metpy
!apt-get -qq install libproj-dev libgeos-dev
!pip install shapely --no-binary shapely cartopy

Cartopy (0.14.2) / MetPy (0.12.2) 使用 Google Colab 时出现 parse(cf) 错误

Cartopy (0.14.2) / MetPy (0.12.2) parse(cf) error when using Google Colab

python

python-3.x

cartopy

google-colaboratory

metpy