在 R 中使用“mclapply”进行并行计算，Linux

Question

如何将下面的代码转换为在 5 核上执行并行作业？

来自串行处理

nfac=length(values)
n=10
for (i in 1:5){
system(sprintf('./tools/siteLevelFLUXNET/morris/%s/prep_model_params.sh %s %s %s',i,nfac,n))
}

到并行处理

system(sprintf('./tools/siteLevelFLUXNET/morris/1/prep_model_params.sh %s %s %s',nfac,n)) on core 1
.
.
.
system(sprintf('./tools/siteLevelFLUXNET/morris/5/prep_model_params.sh %s %s %s',nfac,n)) on core 5

在命令终端上，这可以在两个代码之间使用 & 执行，但我需要从 R

读取 nfac 和 n

Answer 1

你在找这样的东西吗，

library(parallel)
nfac=length(values)
n=10
# define a function 
fun_i<-function(i)
{
  return(system(sprintf('./tools/siteLevelFLUXNET/morris/%s/prep_model_params.sh %s %s %s',i,nfac,n)))
}


do.call("cbind", mclapply(X=1:5,FUN = function(X)fun_i(X),mc.cores=5))

在 R 中使用“mclapply”进行并行计算，Linux

Parallel computing using `mclapply` in R, Linux

r

parallel-processing

mclapply