R 中的哪个包用于计算线性模型的非零零假设 p 值?
What package in R is used to calculate non-zero null hypothesis p-values on linear models?
标准 summary(lm(Height~Weight))
将输出假设检验 H0: Beta1=0 的结果,但如果我有兴趣检验假设 H0: B1=1 是否有一个包可以产生该 p 值?我知道我可以手动计算它并且我知道我可以为双尾测试“翻转置信区间”(通过查看 95% confint
是否包含兴趣点来测试 95% 假设),但我我正在寻找一种简单的方法来生成模拟研究的 p 值。
我不知道有什么软件包可以做到这一点,但您可以使用偏移量来检验这个假设:
## specify null-model parameters
null_int <- 0; null_slope <- 1
## base model
m0 <- lm(mpg ~ disp, data=mtcars)
## include offset as null model
m1 <- update(m0, . ~ . + offset(null_int + null_slope*disp))
比较结果:
cbind(base=coef(m0),offset=coef(m1))
base offset
(Intercept) 29.59985476 29.599855
disp -0.04121512 -1.041215
您可以看到估计的斜率现在低了 1 个单位(因为它是相对于斜率 = 1 的空模型而言的)。汇总值、标准误差、p 值等都将进行适当调整。
您可以使用包 car
中的 linearHypothesis
,例如:
library(car)
fit = lm(Petal.Width ~ Petal.Length,data=iris)
fit
Call:
lm(formula = Petal.Width ~ Petal.Length, data = iris)
Coefficients:
(Intercept) Petal.Length
-0.3631 0.4158
linearHypothesis(fit,"Petal.Length=0.4")
Linear hypothesis test
Hypothesis:
Petal.Length = 0.4
Model 1: restricted model
Model 2: Petal.Width ~ Petal.Length
Res.Df RSS Df Sum of Sq F Pr(>F)
1 149 6.4254
2 148 6.3101 1 0.11526 2.7034 0.1023
还有一个 article 关于这个包的细节。
标准 summary(lm(Height~Weight))
将输出假设检验 H0: Beta1=0 的结果,但如果我有兴趣检验假设 H0: B1=1 是否有一个包可以产生该 p 值?我知道我可以手动计算它并且我知道我可以为双尾测试“翻转置信区间”(通过查看 95% confint
是否包含兴趣点来测试 95% 假设),但我我正在寻找一种简单的方法来生成模拟研究的 p 值。
我不知道有什么软件包可以做到这一点,但您可以使用偏移量来检验这个假设:
## specify null-model parameters
null_int <- 0; null_slope <- 1
## base model
m0 <- lm(mpg ~ disp, data=mtcars)
## include offset as null model
m1 <- update(m0, . ~ . + offset(null_int + null_slope*disp))
比较结果:
cbind(base=coef(m0),offset=coef(m1))
base offset
(Intercept) 29.59985476 29.599855
disp -0.04121512 -1.041215
您可以看到估计的斜率现在低了 1 个单位(因为它是相对于斜率 = 1 的空模型而言的)。汇总值、标准误差、p 值等都将进行适当调整。
您可以使用包 car
中的 linearHypothesis
,例如:
library(car)
fit = lm(Petal.Width ~ Petal.Length,data=iris)
fit
Call:
lm(formula = Petal.Width ~ Petal.Length, data = iris)
Coefficients:
(Intercept) Petal.Length
-0.3631 0.4158
linearHypothesis(fit,"Petal.Length=0.4")
Linear hypothesis test
Hypothesis:
Petal.Length = 0.4
Model 1: restricted model
Model 2: Petal.Width ~ Petal.Length
Res.Df RSS Df Sum of Sq F Pr(>F)
1 149 6.4254
2 148 6.3101 1 0.11526 2.7034 0.1023
还有一个 article 关于这个包的细节。