在 R 中的嵌套 for 循环中跳过迭代和 return NA

Question

给定数据框：

test <- structure(list(IDcount = c(1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2), year = c(1, 
2, 3, 4, 5, 1, 2, 3, 4, 5), Otminus1 = c(-0.28, -0.28, -0.44, 
-0.27, 0.23, -0.03, -0.06, -0.04, 0, 0.02), N.1 = c(NA, -0.1, 
0.01, 0.1, -0.04, -0.04, -0.04, -0.04, -0.05, -0.05), N.2 = c(NA, 
NA, -0.09, 0.11, 0.06, NA, -0.08, -0.08, -0.09, -0.09), N.3 = c(NA, 
NA, NA, 0.01, 0.07, NA, NA, -0.12, -0.13, -0.13), N.4 = c(NA, 
NA, NA, NA, -0.04, NA, NA, NA, -0.05, -0.05), N.5 = c(NA, NA, 
NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, -0.13)), row.names = c(NA, -10L), groups = structure(list(
    IDcount = c(1, 2), .rows = structure(list(1:5, 6:10), ptype = integer(0), class = c("vctrs_list_of", 
    "vctrs_vctr", "list"))), row.names = 1:2, class = c("tbl_df", 
"tbl", "data.frame"), .drop = TRUE), class = c("grouped_df", 
"tbl_df", "tbl", "data.frame"))

和结果数据框：

results <- structure(list(IDcount = c(1, 2), N.1 = c(NA, NA), N.2 = c(NA, 
NA), N.3 = c(NA, NA), N.4 = c(NA, NA), N.5 = c(NA, NA)), row.names = c(NA, 
-2L), class = "data.frame")

我想执行如下嵌套 for 循环：

index <- colnames(test) %>% str_which("N.")

betas <- matrix(nrow=length(unique(test$IDcount)), ncol=2)
colnames(betas) <- c("Intercept", "beta")

for (j in colnames(test)[index]) {
  
  for (i in 1:2) {
    
    betas[i,] <- coef(lm(Otminus1~., test[test$IDcount==i, c("Otminus1", j)]))
  }
  
  betas <- data.frame(betas)
  
  results[[j]] <- betas$beta
}

for 循环应该运行对每一列和每个 ID 进行回归，并将系数写入数据框“结果”。只要每个 ID 在每一列中都有一个值，这就有效。不幸的是，我的数据框“测试”在“N.5”列中缺少值。因此无法执行回归和循环，因为此 ID 的所有值都是 NA。

我现在想调整我的循环，以便仅当特定列中的某个 ID 至少有一个非 NA 值时才执行迭代。

根据这个解释，我尝试执行以下操作：

for (j in colnames(test)[index]) {
  
  for (i in 1:2) {
    
    if(sum(is.na(test[which(test[,1]==i),.]))==length(unique(test$year))) next
    
    betas[i,] <- coef(lm(Otminus1~., test[test$IDcount==i, c("Otminus1", j)]))
  }
  
  betas <- data.frame(betas)
  
  results[[j]] <- betas$beta
}

但这行不通。

我想接收一个看起来像这样的数据框“结果”：

IDcount  N.1    N.2   N.3   N.4    N.5
 1       0.1    0.2   0.5    0.3   NA
 2      -5,3   -0.8  -0.4   -0.1  -0.1

任何帮助将不胜感激！！

Answer 1

您可以使用colSums进行检查：

index <- colnames(test) %>% str_which("N.")

betas <- matrix(nrow=length(unique(test$IDcount)), ncol=2)
colnames(betas) <- c("Intercept", "beta")

for (j in colnames(test)[index]) {
  
  for (i in 1:2) {
    tmp <- test[test$IDcount==i, c("Otminus1", j)]
    if(any(colSums(!is.na(tmp)) == 0)) next
    betas[i,] <- coef(lm(Otminus1~., tmp))
  }
  betas <- data.frame(betas)
  results[[j]] <- betas$beta
}

在 R 中的嵌套 for 循环中跳过迭代和 return NA

Skip iteration and return NA in nested for loop in R

iteration

loops

nested

r

skip