Why does gcc-10 fail to link with error "error: array section is not contiguous in ‘map’ clause" in 2D array openacc application?

Question

我正在尝试使用 gcc-10 在 C 中编译一个基本的 openacc 程序。它适用于一维数组和通过“A[N_x][N_y]”分配的数组，但是当尝试使用 malloc 分配的二维数组时，无论是否连续，我都会收到一条错误消息编译时。下面的例子失败了：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main()
{
  int N_x = 1000;
  int N_y = 1000;
  int i_x;

  // allocate
  double **A;
  A = malloc(N_x * sizeof(double*));
  A[0] = malloc(N_x * N_y * sizeof(double));
  for (i_x = 0; i_x < N_x; i_x++)
  {
    A[i_x] = A[0] + i_x * N_y; // contiguous allocation
//    A[i_x] = malloc(sizeof(double) * N_y);  // non-contiguous allocation
  }
  
  // another example of same error
  // get onto the GPU
  //#pragma acc enter data create (A[0:N_x][0:N_y])
    // get out of the GPU
  //#pragma acc exit data copyout (A[0:N_x][0:N_y])

  // following pragma triggers the "error: array section is not contiguous in ‘map’ clause" error
  #pragma acc parallel loop copy(A[0:N_x][0:N_y])
  for (i_x = 0; i_x < N_x; i_x++)
    A[i_x][i_x] = (double) i_x;

  // free
  free(A[0]);
  free(A);
  

  return 0;
}

我是不是遗漏了什么明显的东西？谢谢您的帮助。顺便说一句，我用

编译

gcc-10 test2.c -fopenacc

在 64 位 Ubuntu 18.04 LTS 系统上使用此 GPU 卡：GeForce GTX 1050 Ti/PCIe/SSE2

Answer 1

代码很好，但我认为 GNU 不支持非连续数据段。我需要推迟 GNU 人员，但相信他们会在未来版本的编译器中开发这种支持。

现在，您需要切换到使用 NVIDIA HPC 编译器 (https://developer.nvidia.com/hpc-sdk) 或重构代码以使用大小为 N_x*[=17= 的一维数组] 与计算索引。类似于：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

#define IDX(n,m,s) ((n*s)+m)

int main()
{
  int N_x = 1000;
  int N_y = 1000;
  int i_x;

  // allocate
  double *A;
  A = malloc(N_x * N_y * sizeof(double*));
  #pragma acc enter data create(A[:N_x*N_y])

  #pragma acc parallel loop present(A)
  for (i_x = 0; i_x < N_x; i_x++)
    A[IDX(i_x,i_x,N_x)] = (double) i_x;

  // free
  free(A);
  return 0;
}

Why does gcc-10 fail to link with error "error: array section is not contiguous in ‘map’ clause" in 2D array openacc application?

Why does gcc-10 fail to link with error "error: array section is not contiguous in ‘map’ clause" in 2D array openacc application?

c

arrays

gcc

gpgpu

openacc