结合 R plumber 和 RAppArmor

Question

我只是想以某种方式组合 plumber 和 RAppArmor 包，用户可以使用 plumber-API 将代码发送到服务器，然后在 RAppArmor 中的配置文件的帮助下安全地对其进行评估。我怎样才能让下面的代码工作：

#* Evaluate the result
#* @post /eval_res
function(func){
  library("RAppArmor")
  data <- cbind(rnorm(100),rnorm(100))
  eval.secure(nrow(data),profile="r-user")
}

此代码块是稍后发生的事情的简化版本。到目前为止，似乎函数中指定的任何对象，例如鉴于 r-user（RAppArmor 的标准配置文件）中的用户限制，数据不能传递给 eval.secure。我什至尝试通过编辑配置文件允许 r-user 完全访问 /**，但没有成功。在本地主机上打开 plumber 并使用带有 curl --data "func=function(x){return(nrow(x))}" "http://localhost:8000/eval_res" 的 curl 来获取 eval.secure() 的结果导致空答案 {}。相同的代码在没有 eval.secure() 和正确 returns [100] 的情况下也能正常工作。有人可以帮助我更好地理解问题甚至修复代码吗？

我目前的解决方法是在 eval.secure() 之前将所有内容保存到 csv，然后在 eval.secure 中读取它，授予对 r 用户配置文件中该文件夹的访问权限，但这绝对是不是一个令人信服的解决方案。

对于那些对函数感到困惑的人：在后面的步骤中，选项 func 将包含一些将被解析和评估的代码，但对于这个小例子，我认为它只会增加不必要的复杂性。

提前致谢！

Answer 1

library("RAppArmor")

#* Evaluate the result
#* @post /eval_res
function(func){
  data <- cbind(rnorm(100),rnorm(100))
  unix::eval_safe(nrow(data), profile="r-user")
}

所以

library("RAppArmor")

#* Evaluate the result
#* @post /eval_res
function(func){
  data <- cbind(rnorm(100),rnorm(100))
  unix::eval_safe(eval(parse(text=func)), profile="r-user")
}

eval.secure只需将所有参数传递给unix::eval_safe即可。 eval.secure 不起作用的原因是因为 eval_safe 期望在它的 parent.frame() 中找到你的变量，在 eval.secure 的情况下是一个空函数体。

eval_safe 使用 parent.frame()

function (expr, tmp = tempfile("fork"), std_out = stdout(), std_err = stderr(), 
    timeout = 0, priority = NULL, uid = NULL, gid = NULL, rlimits = NULL, 
    profile = NULL, device = pdf) 
{
    orig_expr <- substitute(expr)
    out <- eval_fork(expr = tryCatch({
        if (length(priority)) 
            setpriority(priority)
        if (length(rlimits)) 
            set_rlimits(rlimits)
        if (length(gid)) 
            setgid(gid)
        if (length(uid)) 
            setuid(uid)
        if (length(profile)) 
            aa_change_profile(profile)
        if (length(device)) 
            options(device = device)
        graphics.off()
        options(menu.graphics = FALSE)
------> serialize(withVisible(eval(orig_expr, parent.frame())), 
            NULL)
    }, error = function(e) {
        old_class <- attr(e, "class")
        structure(e, class = c(old_class, "eval_fork_error"))
    }, finally = substitute(graphics.off())), tmp = tmp, timeout = timeout, 
        std_out = std_out, std_err = std_err)
    if (inherits(out, "eval_fork_error")) 
        base::stop(out)
    res <- unserialize(out)
    if (res$visible) 
        res$value
    else invisible(res$value)
}

# parent.frame() in eval_safe when using eval.secure
function (...) 
{
  # nothing here  
  unix::eval_safe(...)
}

# parent.frame() when using eval_safe directly
function(func){
  data <- cbind(rnorm(100),rnorm(100))
  # Your stuff is here
  unix::eval_safe(nrow(data), profile="r-user")
}

结合 R plumber 和 RAppArmor

Combining R plumber and RAppArmor

r

apparmor

plumber