在带有 matplotlib 的 PDF 散点输出中不考虑标记大小

Question

似乎 pylab 散点图的标记大小在导出为 PDF 时有不同的行为？请注意，在图像中，左下角的 X 很大（PDF 的屏幕截图）。在 png 输出和屏幕 show() 中看起来不错。不过，根据附加的代码，它们应该匹配。 PDF 输出有问题吗？

import numpy as np
import pylab as plt

x=np.arange(1,10)
y=np.arange(1,10)
s=np.arange(1,100,10)

fig, ax = plt.subplots(figsize=(5, 5))

ax.scatter(x,y, marker='x', color='gray',s=s)
plt.savefig('test.png')
plt.savefig('test.pdf')
plt.show()

PDF 输出：

PNG 输出：

Answer 1

您的 s 与 x 和 y 的长度不同。

len(s) # 10
len(x) # 9
len(y) # 9

为什么这会导致这种行为，不知道。但是如果你设置 s 为相同的长度，可能会像这样：

s = np.arange(1,100,11)

应该可以。

因此，完整代码：

import numpy as np
import pylab as plt

x = np.arange(1, 10)
y = np.arange(1, 10)
s = np.arange(1, 100, 11)

fig, ax = plt.subplots(figsize = (5, 5))

ax.scatter(x, y, marker = 'x', color = 'gray', s = s)
plt.savefig('test.png')
plt.savefig('test.pdf')
plt.show()

将给予：

PNG:

PDF:

我不知道您当前使用的是哪个版本，但最新版本 (3.3.3) 会在运行您的原始代码：

时给出 ValueError

ValueError: s must be a scalar, or the same size as x and y

这基本上描述了我的答案。

在带有 matplotlib 的 PDF 散点输出中不考虑标记大小

Marker size not respected in scatter output to PDF w/ matplotlib

python

pdf

pdf-generation

matplotlib

PNG:

PDF: