`levels<-`(`tmp`, value = as.character(levels)) 错误：因子水平 [3] 重复

Question

我正在尝试使用自动绘图绘制分面生存曲线，但协变量和分面的组合会重复因子中的水平

library(survival)
library(ggfortify)
fit <- survfit( Surv(time, status) ~ inst + sex,
                 data = lung )

autoplot(fit, facets = TRUE)


Error in `levels<-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) : 
  factor level [3] is duplicated

有人用自动绘图成功地绘制了多面生存曲线吗？我试过 survminer，但协变量占据了大部分绘图区域，情节看起来很可怕。

Answer 1

我认为你应该再看看 ggsurvplot，因为 autoplot.survfit 似乎不喜欢有一个以上的独立因子变量（无论你是否分面）。

ggsurvplot 函数 returns 一个 ggplot 对象，因此您无需满足于默认选项。您可以根据需要添加比例和样式。以你的例子为例，我们可以这样做：

library(survival)
library(ggfortify)
library(survminer)

fit <- survfit( Surv(time, status) ~ inst + sex,
                 data = lung )

p <- ggsurvplot(fit, facet.by = "inst", conf.int = TRUE) + 
  theme(strip.background = element_blank(),
        axis.line.x = element_line())

p$facet <- facet_wrap(.~inst, ncol = 3, nrow = 6, scales = "free")

p

`levels<-`(`tmp`, value = as.character(levels)) 错误：因子水平 [3] 重复

Error in `levels<-`(`tmp`, value = as.character(levels)) : factor level [3] is duplicated

r

ggplot2

ggfortify

survival

autoplot

`levels<-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) 错误：因子水平 [3] 重复

Error in `levels<-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) : factor level [3] is duplicated

r

ggplot2

ggfortify

survival

autoplot

`levels<-`(`tmp`, value = as.character(levels)) 错误：因子水平 [3] 重复

Error in `levels<-`(`tmp`, value = as.character(levels)) : factor level [3] is duplicated