两台主机之间的差异运行相同 docker 命令

Question

我和一位同事有一个很大的Docker难题。

当我们运行以下命令时，我们得到不同的结果。

docker run -it python:3.8.6 /bin/bash
pip install fbprophet

对我来说，它安装完美，而对他来说，它会产生错误并无法安装。我以为docker的全部意义就是为了防止这种问题，所以我真的很困惑。

我在下面提供更多细节，但我的主要问题是：

我们怎么可能得到不同的结果？

更多详情：

我们都运行宁 Docker 在 Catalina 上使用具有相似规格的新 MacBook Pro。他的 Docker 引擎版本 20.x.x 比我的 19.X.X 稍新。还有：

他尝试了他能想到的所有命令来清理 Docker 中的东西。
我们验证图像 ID 的哈希值相同。
我们的资源设置也是一样的。
他尝试重新安装 Docker 并更改为 python (3.7) 的其他版本。
过去三天我们同时尝试了多次。

结果总是一样的：他得到错误而我没有。

他得到的错误如下。

Error:
Installing collected packages: six, pytz, python-dateutil, pymeeus, numpy, pyparsing, pillow, pandas, korean-lunar-calendar, kiwisolver, ephem, Cython, cycler, convertdate, tqdm, setuptools-git, pystan, matplotlib, LunarCalendar, holidays, cmdstanpy, fbprophet
    Running setup.py install for fbprophet ... error
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: /usr/local/bin/python -u -c ‘import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = ‘“’”‘/tmp/pip-install-l516b8ts/fbprophet_80d5f400081541a2bf6ee26d2785e363/setup.py’“‘”’; __file__=‘“’”‘/tmp/pip-install-l516b8ts/fbprophet_80d5f400081541a2bf6ee26d2785e363/setup.py’“‘”’;f=getattr(tokenize, ‘“’”‘open’“‘”’, open)(__file__);code=f.read().replace(‘“’”‘\r\n’“‘”’, ‘“’”‘\n’“‘”’);f.close();exec(compile(code, __file__, ‘“’”‘exec’“‘”’))' install --record /tmp/pip-record-7n8tvfkb/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /usr/local/include/python3.8/fbprophet
         cwd: /tmp/pip-install-l516b8ts/fbprophet_80d5f400081541a2bf6ee26d2785e363/
    Complete output (10 lines):
    running install
    running build
    running build_py
    creating build
    creating build/lib
    creating build/lib/fbprophet
    creating build/lib/fbprophet/stan_model
    Importing plotly failed. Interactive plots will not work.
    INFO:pystan:COMPILING THE C++ CODE FOR MODEL anon_model_dfdaf2b8ece8a02eb11f050ec701c0ec NOW.
    error: command ‘gcc’ failed with exit status 1
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: /usr/local/bin/python -u -c ‘import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = ‘“’”‘/tmp/pip-install-l516b8ts/fbprophet_80d5f400081541a2bf6ee26d2785e363/setup.py’“‘”’; __file__=‘“’”‘/tmp/pip-install-l516b8ts/fbprophet_80d5f400081541a2bf6ee26d2785e363/setup.py’“‘”’;f=getattr(tokenize, ‘“’”‘open’“‘”’, open)(__file__);code=f.read().replace(‘“’”‘\r\n’“‘”’, ‘“’”‘\n’“‘”’);f.close();exec(compile(code, __file__, ‘“’”‘exec’“‘”’))' install --record /tmp/pip-record-7n8tvfkb/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /usr/local/include/python3.8/fbprophet Check the logs for full command output.

请注意，运行宁我提供的两个命令总是会产生错误，但它们并不重要。在 fbprophet 解决这些小错误之前升级 setuptools 并安装依赖项。上面显示的错误是不同的，与gcc有关，并且只发生在某些人身上。

可选附加问题：

我们如何解决它？
我们如何防止像这样的不可重现的结果？
升级docker引擎版本会破坏容器吗？

Answer 1

。这个问题不仅仅是docker上的问题，而是fbprophet本身造成的。要避免：

docker run -it python:3.8.6 /bin/bash
pip install numpy pandas blahblah...
pip install fbprophet

Answer 2

我们如何解决它？

您的错误报告了 GCC/编译问题。
快速搜索主要显示与 python / gcc 版本 (one, two, three) 有关的问题。
但你是对的，这看起来不像是在一个特定的容器内发生的。

看起来像是某种 OOM problem。

Also, is this a VM? Stan requires a significant amount of memory to compile the models, and this error can occur if you run out of RAM while it is compiling.

我做了一些测试。
在我的机器上，编译过程消耗了高达 2.4 Gb 的 RAM。

cat /etc/redhat-release
CentOS Linux release 7.9.2009 (Core)

uname -r
3.10.0-1160.6.1.el7.x86_64

docker --version
Docker version 20.10.1, build 831ebea

# works fine
docker run --rm -it -m 3G python:3.8.6 /bin/bash

# fails with error: command 'gcc' failed with exit status 1
# actually it was killed by OOM killer
docker run --rm -it -m 2G python:3.8.6 /bin/bash

# yes, here he is
tail -f /var/log/messages | grep -i 'killed process'
Dec 22 08:34:09 cent7-1 kernel: Killed process 5631 (cc1plus), UID 0, total-vm:2073600kB, anon-rss:1962404kB, file-rss:15332kB, shmem-rss:0kB
Dec 22 08:35:56 cent7-1 kernel: Killed process 5640 (cc1plus), UID 0, total-vm:2056816kB, anon-rss:1947392kB, file-rss:15308kB, shmem-rss:0kB

检查有问题的机器上的 OOM killer 日志。
Docker 是否有足够的可用内存？

升级docker引擎版本会不会破坏容器？

一般来说，应该不是这样的。
但是对于 v20.10.0 Docker 引入了非常大的一组 changes 与内存和 cgroups 相关。

在排除所有明显原因后（比如您朋友的机器没有足够的 RAM），您可能需要深入研究 docker 与内存/cgroups 等相关的守护进程设置

同一个容器在两台电脑上怎么会产生不同的结果？

嗯，从技术上讲这是完全可能的。
容器化程序 still use host OS kernel.
并非所有内核设置都是“命名空间”，即。 e.可以专门为一个特定的容器设置。
其中很多（实际上是大多数）仍然是全局的，并且会影响程序的行为。

虽然我认为这与您的问题无关。
但对于依赖于特定内核设置的复杂程序，必须加以考虑。

两台主机之间的差异运行相同 docker 命令

Discrepancy between two hosts running the same docker commands

python

docker

pip

facebook-prophet

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两台主机之间的差异 运行 相同 docker 命令

Discrepancy between two hosts running the same docker commands

python

docker

pip

facebook-prophet

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两台主机之间的差异运行相同 docker 命令