没有匹配函数调用 sqrt

Question

在 Rcpp 中编写用于按列计算样本偏度的函数我在使用 sqrt() 函数时遇到了麻烦。我知道 sqrt(x) 适用于 NumericVector 类型（在单独的文件中对其进行了测试），但是在我的代码中（我试图传递双打）它不起作用。

这是我的代码：

#include <Rcpp.h>
#include <cmath>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
NumericVector colSkew(NumericMatrix x) {
    int nc = x.ncol();
    int nr = x.nrow();
    NumericVector colS(nc);
    for(int i = 0; i < nc; i++){
        double cMean = mean(x( _ ,i));
        double xSq = 0;
        double cSt = 0;
          for(int j = 0; j < nr; j++){
              xSq += std::pow(x(j,i), 2.0);
              cSt += std::pow(x(j,i) - cMean, 3.0);
          }
          double colMsq = nr * std::pow(cMean, 2.0);
          double cTT = sqrt((xSq - colMsq)) / (nr - 1);
          double colVar = cTT / (nr - 1);
          double colNew = nr * std::pow(colVar, 3);
          colS[i] = cSt / colNew;
      }
    return(colS);
}

我尝试了 std::sqrt()，但出现了“对 sqrt 的调用不明确”的错误。对于那个，Getting: error C2668: 'sqrt' : ambiguous call to overloaded function, nor http://dirk.eddelbuettel.com/code/rcpp.examples.html 和

inline static double sqrt_double( double x ){ return ::sqrt( x ); }

有帮助。（后者本身就有“无匹配功能”或“模棱两可”的问题）。代码本身可以编译，但不能正常工作（我可以调用函数但结果不正常）。

可重现的例子：

# First load the cpp function, however you want to;
Create example data:
A = matrix(rchisq(1000, 5), nrow = 100)
library(timeDate)
skew.1 = apply(A, 2, skewness)
skew.2 = colSkew(A)

# A custom R-function which should mimic the cpp function
colSkew.r = function(x){
  
  nc = ncol(x)
  nr = nrow(x)
  colS = numeric(nc)
  cMean = colMeans(x)
  xSq = colSums(x^2)
  cSt = 0
  for(i in 1:nc){
      cSt = sum((x[,i]-cMean[i])^3)
      colMsq = nr * cMean[i]^2
      cTT = sqrt((xSq[i] - colMsq) / (nr - 1))
      colNew = nr * cTT^3
      colS[i] = cSt / colNew
  }
  return(colS)
}
skew.3 = colSkew.r(A)

Answer 1

简而言之，我们可以避免一些反复出现的常见初学者错误：

不包括不需要的headers（大部分无害，但Rcpp已经带来了数学headers）
不要使用全局扁平化命名空间Rcpp，尤其是在符号可见性出现编译错误之后

有了它以及它构建和运行所需的最小更改（和 returns 一些东西 non-sensical 但我把它留给你来解决 :)

还有其他方法可以解决这个问题，因为 std:: 符号和 Rcpp 符号通常可以通过不同的签名愉快地共存。

代码

#include <Rcpp.h>

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::NumericVector colSkew(Rcpp::NumericMatrix x) {
    int nc = x.ncol();
    int nr = x.nrow();
    Rcpp::NumericVector colS(nc);
    for(int i = 0; i < nc; i++){
      double cMean = Rcpp::mean(x( Rcpp::_ ,i));
        double xSq = 0;
        double cSt = 0;
          for(int j = 0; j < nr; j++){
              xSq += std::pow(x(j,i), 2.0);
              cSt += std::pow(x(j,i) - cMean, 3.0);
          }
          double colMsq = nr * std::pow(cMean, 2.0);
          double cTT = std::sqrt((xSq - colMsq)) / (nr - 1);
          double colVar = cTT / (nr - 1);
          double colNew = nr * std::pow(colVar, 3);
          colS[i] = cSt / colNew;
      }
    return(colS);
}

/*** R
set.seed(42)
colSkew( matrix(rnorm(100), 100, 1) )
*/

输出

> sourceCpp("answer.cpp")

> set.seed(42)

> colSkew( matrix(rnorm(100), 100, 1) )
[1] -448250877
>

没有匹配函数调用 sqrt

No matching function for call to sqrt

c++

r

sqrt

rcpp

代码

输出