具有多重插补的倾向得分匹配
Propensity score matching with multiple imputation
我有一个包含几个缺失值的数据集,需要 运行 倾向得分匹配,使用变量 'y' 作为治疗变量,x1、x2 和 x3 作为调整变量。
通过将以下代码与 Matchit
结合使用
ModMatch <- matchit(y ~ x1+x2+x3, method = 'nearest', data = data)
我得到错误'Missing values exist in the data'
因此,我尝试 运行 使用鼠标进行多重插补:
ImputedDF <- mice(data)
ModMatch <- matchit(y ~ x1+x2+x3, method = 'nearest', data = ImputedDF)
我收到错误 'cannot coerce an object of class mids to a dataframe'。
我可能需要一种方法来打印估算的数据框,有人知道这是否可行吗?
您应该使用 MatchThem
包,它是专门为在多重插补后执行匹配而设计的。 matchthem()
函数调用 matchit()
并在每个插补数据集中执行匹配。然后,您可以使用 cobalt
包检查估算数据集中的余额,该包旨在与 MatchThem
兼容。之后可以使用MatchThem
中的with()
函数来估计效果。这是此工作流程的示例:
library(mice); library(MatchThem); library(cobalt)
#Impute the data with 20 imputations (more is better)
imp <- mice(data, m = 20)
#Perform matching within each imputation
ModMatch <- matchthem(y ~ x1+x2+x3, method = 'nearest', data = imp)
#Assess balance
bal.tab(ModMatch, un = TRUE)
love.plot(Modmatch)
#Estimate the effect
summary(pool(with(ModMatch, svyglm(outcome ~ y + x1 + X2 + X2))))
我要提醒您,您使用的是高级统计技术,未经高级培训的人不应使用这些技术。在 mice
和 MatchThem
中使用默认值很少是一个好主意。
关于您收到的错误消息:调用 mice()
的输出不是数据框;这是一个 mids
对象。 matchit()
中的 data
参数需要一个数据框。 matchthem()
接受一个 mids
对象以在每个估算的数据集中执行匹配。
我有一个包含几个缺失值的数据集,需要 运行 倾向得分匹配,使用变量 'y' 作为治疗变量,x1、x2 和 x3 作为调整变量。 通过将以下代码与 Matchit
结合使用ModMatch <- matchit(y ~ x1+x2+x3, method = 'nearest', data = data)
我得到错误'Missing values exist in the data'
因此,我尝试 运行 使用鼠标进行多重插补:
ImputedDF <- mice(data)
ModMatch <- matchit(y ~ x1+x2+x3, method = 'nearest', data = ImputedDF)
我收到错误 'cannot coerce an object of class mids to a dataframe'。 我可能需要一种方法来打印估算的数据框,有人知道这是否可行吗?
您应该使用 MatchThem
包,它是专门为在多重插补后执行匹配而设计的。 matchthem()
函数调用 matchit()
并在每个插补数据集中执行匹配。然后,您可以使用 cobalt
包检查估算数据集中的余额,该包旨在与 MatchThem
兼容。之后可以使用MatchThem
中的with()
函数来估计效果。这是此工作流程的示例:
library(mice); library(MatchThem); library(cobalt)
#Impute the data with 20 imputations (more is better)
imp <- mice(data, m = 20)
#Perform matching within each imputation
ModMatch <- matchthem(y ~ x1+x2+x3, method = 'nearest', data = imp)
#Assess balance
bal.tab(ModMatch, un = TRUE)
love.plot(Modmatch)
#Estimate the effect
summary(pool(with(ModMatch, svyglm(outcome ~ y + x1 + X2 + X2))))
我要提醒您,您使用的是高级统计技术,未经高级培训的人不应使用这些技术。在 mice
和 MatchThem
中使用默认值很少是一个好主意。
关于您收到的错误消息:调用 mice()
的输出不是数据框;这是一个 mids
对象。 matchit()
中的 data
参数需要一个数据框。 matchthem()
接受一个 mids
对象以在每个估算的数据集中执行匹配。