使用数据框后保持变量类型

Question

我正在尝试使用 R 包 clustMixType 中的 kproto() 函数在 Julia 中对混合类型数据进行聚类，但出现错误 No numeric variables in x! Try using kmodes() from package...。我的数据应该有 3 个变量：2 个连续变量和 1 个分类变量。似乎在我使用 DataFrame() 之后，所有变量都变得明确了。有没有办法避免在使用 DataFrame() 后更改变量类型，以便我有混合类型的数据（连续和分类）来使用 kproto()?

using RCall
@rlibrary clustMixType

# group 1 variables
x1=rand(Normal(0,3),10)
x2=rand(Normal(1,2),10)
x3=["1","1","2","2","0","1","1","2","2","0"]
g1=hcat(x1,x2,x3) 

# group 2 variables
y1=rand(Normal(0,4),10)
y2=rand(Normal(-1,6),10)
y3=["1","1","2","1","1","2","2","0","2","0"]
g2=hcat(y1,y2,y3)
 
#create the data
df0=vcat(g1,g2)
df1 = DataFrame(df0) 

#use R function
R"kproto($df1, 2)"

Answer 1

我对 R 包及其期望的输入类型一无所知，但问题可能在于如何构建数据矩阵，而不是 DataFrame 构造函数本身。

当您连接一个数字列和一个字符串列时，Julia 会返回结果矩阵的元素类型 Any：

julia> g1=hcat(x1,x2,x3)
10×3 Matrix{Any}:
  0.708309  -4.84767   "1"
  0.566883  -0.214217  "1"
...

这意味着您的 df0 矩阵是：

julia> #create the data
       df0=vcat(g1,g2)
20×3 Matrix{Any}:
  0.708309   -4.84767   "1"
  0.566883   -0.214217  "1"
...

和 DataFrame 构造函数将只携带这种类型信息的缺失，而不是试图推断列类型。

julia> DataFrame(df0)
20×3 DataFrame
 Row │ x1         x2         x3  
     │ Any        Any        Any 
─────┼───────────────────────────
   1 │ 0.708309   -4.84767   1
   2 │ 0.566883   -0.214217  1
...

解决这个问题的一个简单方法是不将您的列连接成一个矩阵，而是从列构建 DataFrame：

julia> DataFrame([vcat(x1, y1), vcat(x2, y2), vcat(x3, y3)])
20×3 DataFrame
 Row │ x1         x2          x3     
     │ Float64    Float64     String 
─────┼───────────────────────────────
   1 │  0.708309   -4.84767   1
   2 │  0.566883   -0.214217  1
...

如您所见，我们现在在生成的 DataFrame 中有两个 Float64 数值列 x1 和 x2。

Answer 2

作为对 Nils 的好回答的补充（因为问题确实是在构造矩阵时而不是在创建 DataFrame 时）有这个小技巧：

julia> df = DataFrame([1 1.0 "1"; 2 2.0 "2"], [:int, :float, :string])
2×3 DataFrame
 Row │ int  float  string
     │ Any  Any    Any
─────┼────────────────────
   1 │ 1    1.0    1
   2 │ 2    2.0    2

julia> identity.(df)
2×3 DataFrame
 Row │ int    float    string
     │ Int64  Float64  String
─────┼────────────────────────
   1 │     1      1.0  1
   2 │     2      2.0  2

使用数据框后保持变量类型

Keep variables type after using data frame

dataframe

julia

cluster-analysis