从果蝇基因符号到人类基因符号的 ID 转换
ID conversion from Drosophila Gene Symbols to Human Gene Symbols
我正在寻找将 Drosophila melanogaster 基因 ID 转换为智人基因 ID 的 R 解决方案（或通用逻辑解决方案）。使用 R/BiomaRt 是有问题的，因为 BiomaRt 数据集不断变化的性质，以及它对互联网连接和服务器状态的依赖。
基因id是FlyBase格式，但我也有人类友好的基因符号，例如
FBgn0259938 cwo
FBgn0036285 toe
FBgn0264490 Eip93F
FBgn0034903 sona
有什么想法吗？谢谢！
我想你可以使用 FlyBase orthologs table，它会定期更新并且每个 ortholog 都有 DIOPT 分数：ftp://ftp.flybase.net/releases/current/precomputed_files/orthologs/dmel_human_orthologs_disease_fb_2020_06.tsv.gz
我正在寻找将 Drosophila melanogaster 基因 ID 转换为智人基因 ID 的 R 解决方案（或通用逻辑解决方案）。使用 R/BiomaRt 是有问题的，因为 BiomaRt 数据集不断变化的性质，以及它对互联网连接和服务器状态的依赖。
基因id是FlyBase格式，但我也有人类友好的基因符号，例如
FBgn0259938 cwo
FBgn0036285 toe
FBgn0264490 Eip93F
FBgn0034903 sona
有什么想法吗？谢谢！
我想你可以使用 FlyBase orthologs table，它会定期更新并且每个 ortholog 都有 DIOPT 分数：ftp://ftp.flybase.net/releases/current/precomputed_files/orthologs/dmel_human_orthologs_disease_fb_2020_06.tsv.gz