如何清除 aws ec2 ubuntu s3 cli 上的总线错误(核心转储)
how to clear Bus error (core dumped) on aws ec2 ubuntu s3 cli
我正在使用 aws ec2 ubuntu 并且有 ssh 连接。
从 ssh 连接输入到 s3 的所有命令都会产生错误:
Bus error (core dumped)
最初,我试图从 mybucket 复制到服务器:
aws s3 cp s3://mybucket ./
但是结果是错误的。即使是 ls 命令也会产生错误。我不知道如何解决这个问题。
几天前,我使用这些 instructions 扩展了系统的 ebs 卷。
df -h 命令产生这个:
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/root 31G 13G 19G 40% /
devtmpfs 16G 0 16G 0% /dev
tmpfs 16G 8.0K 16G 1% /dev/shm
tmpfs 3.2G 940K 3.2G 1% /run
tmpfs 5.0M 0 5.0M 0% /run/lock
tmpfs 16G 0 16G 0% /sys/fs/cgroup
/dev/loop0 33M 33M 0 100% /snap/amazon-ssm-agent/2996
/dev/loop2 98M 98M 0 100% /snap/core/10577
/dev/loop3 98M 98M 0 100% /snap/core/10583
/dev/loop1 34M 34M 0 100% /snap/amazon-ssm-agent/3552
/dev/loop4 56M 56M 0 100% /snap/core18/1885
/dev/loop6 56M 56M 0 100% /snap/core18/1944
/dev/loop7 68M 68M 0 100% /snap/lxd/18150
tmpfs 3.2G 0 3.2G 0% /run/user/1000
tmpfs 10M 10M 0 100% /tmp
/dev/loop8 70M 70M 0 100% /snap/lxd/19032
和 lsblk 命令产生这个:
NAME MAJ:MIN RM SIZE RO TYPE MOUNTPOINT
loop0 7:0 0 32.3M 1 loop /snap/amazon-ssm-agent/2996
loop1 7:1 0 33.3M 1 loop /snap/amazon-ssm-agent/3552
loop2 7:2 0 97.9M 1 loop /snap/core/10577
loop3 7:3 0 97.9M 1 loop /snap/core/10583
loop4 7:4 0 55.3M 1 loop /snap/core18/1885
loop6 7:6 0 55.4M 1 loop /snap/core18/1944
loop7 7:7 0 67.8M 1 loop /snap/lxd/18150
loop8 7:8 0 69.8M 1 loop /snap/lxd/19032
xvda 202:0 0 32G 0 disk
└─xvda1 202:1 0 32G 0 part /
今天,工作照常进行,直到我输入命令:
grep -vf MergedSamplesEdited.vcf ../resources/plink.GRCh37.autosome.map
系统Killed
进程。
然后我可以执行更多的 grep / awk 命令,包括我应该执行的命令而不是上面的 grep 行:
gawk -F$'\t' 'FNR == NR {a[]; next;} {if ( in a) {print [=16=] } }' oldfile.ibd ../resources/plink.GRCh37.autosome.map > newfile.ibd
需要从 s3 存储桶中复制文件,我尝试了上面的 aws s3 命令,但出现总线错误。
我搜索了一个解决方案并找到了关于总线错误的响应,但这些响应似乎非常具体并且不适用于我的情况。例如,Git add . Gives me Bus error (core dumped).
非常感谢您的帮助。
同样的问题和同样的设置 - 服务器重启为我解决了。
$ sudo reboot
我正在使用 aws ec2 ubuntu 并且有 ssh 连接。
从 ssh 连接输入到 s3 的所有命令都会产生错误:
Bus error (core dumped)
最初,我试图从 mybucket 复制到服务器:
aws s3 cp s3://mybucket ./
但是结果是错误的。即使是 ls 命令也会产生错误。我不知道如何解决这个问题。
几天前,我使用这些 instructions 扩展了系统的 ebs 卷。
df -h 命令产生这个:
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/root 31G 13G 19G 40% /
devtmpfs 16G 0 16G 0% /dev
tmpfs 16G 8.0K 16G 1% /dev/shm
tmpfs 3.2G 940K 3.2G 1% /run
tmpfs 5.0M 0 5.0M 0% /run/lock
tmpfs 16G 0 16G 0% /sys/fs/cgroup
/dev/loop0 33M 33M 0 100% /snap/amazon-ssm-agent/2996
/dev/loop2 98M 98M 0 100% /snap/core/10577
/dev/loop3 98M 98M 0 100% /snap/core/10583
/dev/loop1 34M 34M 0 100% /snap/amazon-ssm-agent/3552
/dev/loop4 56M 56M 0 100% /snap/core18/1885
/dev/loop6 56M 56M 0 100% /snap/core18/1944
/dev/loop7 68M 68M 0 100% /snap/lxd/18150
tmpfs 3.2G 0 3.2G 0% /run/user/1000
tmpfs 10M 10M 0 100% /tmp
/dev/loop8 70M 70M 0 100% /snap/lxd/19032
和 lsblk 命令产生这个:
NAME MAJ:MIN RM SIZE RO TYPE MOUNTPOINT
loop0 7:0 0 32.3M 1 loop /snap/amazon-ssm-agent/2996
loop1 7:1 0 33.3M 1 loop /snap/amazon-ssm-agent/3552
loop2 7:2 0 97.9M 1 loop /snap/core/10577
loop3 7:3 0 97.9M 1 loop /snap/core/10583
loop4 7:4 0 55.3M 1 loop /snap/core18/1885
loop6 7:6 0 55.4M 1 loop /snap/core18/1944
loop7 7:7 0 67.8M 1 loop /snap/lxd/18150
loop8 7:8 0 69.8M 1 loop /snap/lxd/19032
xvda 202:0 0 32G 0 disk
└─xvda1 202:1 0 32G 0 part /
今天,工作照常进行,直到我输入命令:
grep -vf MergedSamplesEdited.vcf ../resources/plink.GRCh37.autosome.map
系统Killed
进程。
然后我可以执行更多的 grep / awk 命令,包括我应该执行的命令而不是上面的 grep 行:
gawk -F$'\t' 'FNR == NR {a[]; next;} {if ( in a) {print [=16=] } }' oldfile.ibd ../resources/plink.GRCh37.autosome.map > newfile.ibd
需要从 s3 存储桶中复制文件,我尝试了上面的 aws s3 命令,但出现总线错误。
我搜索了一个解决方案并找到了关于总线错误的响应,但这些响应似乎非常具体并且不适用于我的情况。例如,Git add . Gives me Bus error (core dumped).
非常感谢您的帮助。
同样的问题和同样的设置 - 服务器重启为我解决了。
$ sudo reboot