求解广义特征向量和特征值以获得共同基础
Solving Generalized eigenvectors and eigen values to get a common basis
我正在寻找在 Matlab 中求解广义特征向量和特征值问题的方法。为此,我测试了2种方法。
- 如果广义问题表述为:
然后,我们可以在每边乘以B^(-1),例如:
所以,从理论上讲,就是简单经典的特征值问题
最后,在 Matlab 中,我用 A=FISH_sp
和 B=FISH_xc
简单地做了:
[Phi, Lambda] = eig(inv(FISH_xc)*FISH_sp);
但是当我在一个简单的 Fisher 合成之后做出结果时,结果不正确(约束太糟糕并且还使出现 nan
值。我不知道为什么我没有得到与下面是第二个。
- 第二种方法来自以下paper.
总而言之,第 7 页描述了所用的算法。我遵循了该算法的所有步骤,并且在进行 Fisher 合成时它似乎给出了更好的结果。
这里是感兴趣的部分(抱歉,我认为 Latex 在 stakoverflow 上不可用):
这是我用于此方法的小 Matlab 脚本:
% Diagonalize A = FISH_sp and B = Fish_xc
[V1,D1] = eig(FISH_sp);
[V2,D2] = eig(FISH_xc);
% Applying each step of algorithm 1 on page 7
phiB_bar = V2*(D2.^(0.5)+1e-10*eye(7))^(-1);
barA = inv(phiB_bar)*FISH_sp*phiB_bar;
[phiA, vA] = eig(barA);
Phi = phiB_bar*phiA;
最后,我找到了 phi 特征向量矩阵 (phi) 和 lambda 对角矩阵 (D1)。
- 现在,我想在这个广义问题和 A 和 B 矩阵之间的最终公共特征向量(分别是 Fish_sp 和 Fish_xc 之间做 link ).有没有办法执行此操作?
的确,我到现在为止所做的就是找到A*Phi
和B*Phi
之间的平行关系,link由Lambda对角矩阵。也许,我们可以这样安排这种关系:
A*Phi'=Phi'*Lambda_A'
和
B*Phi'=Phi'*Lambda_B'
- 从数值的角度来看,为什么 1) 的方法和 3) 的方法得到的结果不一样?我的意思是
Phi
特征向量矩阵和 Lambda
对角矩阵。
但是,这是相同的公式。
编辑:
如果我想说 phi 对角化了 A=FISH_sp 和 B=FISH_xc 矩阵,我得到了错误的结果。
的确,通过这样做:
% Marginalizing over uncommon parameters between the two matrices
COV_GCsp_first = inv(FISH_GCsp);
COV_XC_first = inv(FISH_XC);
COV_GCsp = COV_GCsp_first(1:N,1:N);
COV_XC = COV_XC_first(1:N,1:N);
% Invert to get Fisher matrix
FISH_sp = inv(COV_GCsp);
FISH_xc = inv(COV_XC);
% Diagonalize
[V1,D1] = eig(FISH_sp);
[V2,D2] = eig(FISH_xc);
% Build phi matrix
% V2 corresponds to eigen vectors of FISH_xc
phiB_bar = V2*diag(diag(D2.^(-0.5)));
% DEBUG : check identity matrix => OK, Identity matrix found !
id = (phiB_bar')*FISH_xc*phiB_bar
% phi matrix
barA = (phiB_bar')*FISH_sp*phiB_bar
[phiA, vA] = eig(barA);
phi = phiB_bar*phiA;
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues found !
FISH_sp*V1./V1
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues found !
FISH_xc*V2./V2
% Check if phi diagolize FISH_sp : NOT OK, not identical eigenvalues
FISH_sp*phi./phi
% Check if phi diagolize FISH_sp : NOT OK, not identical eigenvalues
FISH_xc*phi./phi
所以,我没有发现特征向量矩阵 Phi
使 A 和 B 对角化,因为预期的特征值不是相同值的列。
顺便说一下,我发现特征值 D1
和 D2
来自 :
[V1,D1] = eig(FISH_sp);
[V2,D2] = eig(FISH_xc);
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues D1 found !
FISH_sp*V1./V1
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues D2 found !
FISH_xc*V2./V2
我该如何解决这个错误的结果(我说的是比率:
FISH_sp*phi./phi
FISH_xc*phi./phi
FISH_sp
和 FISH_xc
的给定列不提供相同的值)
)
??在论文中,他们说 phi
使 A=FISH_sp
和 B=FISH_xc
对角化,但我无法重现它。
如果有人能看到我的错误在哪里...
您定义了 barA = inv(phiB_bar)*FISH_sp*phiB_bar
。从等式。 (39) 在手稿中它看起来应该是 barA = transpose(phiB_bar)*FISH_sp*phiB_bar
而不是。
此外,当 B
是单数时,您的方法 1 失败(不存在逆)。但是,MATLAB 的 eig(A,B)
也应该处理单数 B
,如果我没记错的话。
我正在寻找在 Matlab 中求解广义特征向量和特征值问题的方法。为此,我测试了2种方法。
- 如果广义问题表述为:
然后,我们可以在每边乘以B^(-1),例如:
所以,从理论上讲,就是简单经典的特征值问题
最后,在 Matlab 中,我用 A=FISH_sp
和 B=FISH_xc
简单地做了:
[Phi, Lambda] = eig(inv(FISH_xc)*FISH_sp);
但是当我在一个简单的 Fisher 合成之后做出结果时,结果不正确(约束太糟糕并且还使出现 nan
值。我不知道为什么我没有得到与下面是第二个。
- 第二种方法来自以下paper.
总而言之,第 7 页描述了所用的算法。我遵循了该算法的所有步骤,并且在进行 Fisher 合成时它似乎给出了更好的结果。
这里是感兴趣的部分(抱歉,我认为 Latex 在 stakoverflow 上不可用):
这是我用于此方法的小 Matlab 脚本:
% Diagonalize A = FISH_sp and B = Fish_xc
[V1,D1] = eig(FISH_sp);
[V2,D2] = eig(FISH_xc);
% Applying each step of algorithm 1 on page 7
phiB_bar = V2*(D2.^(0.5)+1e-10*eye(7))^(-1);
barA = inv(phiB_bar)*FISH_sp*phiB_bar;
[phiA, vA] = eig(barA);
Phi = phiB_bar*phiA;
最后,我找到了 phi 特征向量矩阵 (phi) 和 lambda 对角矩阵 (D1)。
- 现在,我想在这个广义问题和 A 和 B 矩阵之间的最终公共特征向量(分别是 Fish_sp 和 Fish_xc 之间做 link ).有没有办法执行此操作?
的确,我到现在为止所做的就是找到A*Phi
和B*Phi
之间的平行关系,link由Lambda对角矩阵。也许,我们可以这样安排这种关系:
A*Phi'=Phi'*Lambda_A'
和
B*Phi'=Phi'*Lambda_B'
- 从数值的角度来看,为什么 1) 的方法和 3) 的方法得到的结果不一样?我的意思是
Phi
特征向量矩阵和Lambda
对角矩阵。
但是,这是相同的公式。
编辑:
如果我想说 phi 对角化了 A=FISH_sp 和 B=FISH_xc 矩阵,我得到了错误的结果。
的确,通过这样做:
% Marginalizing over uncommon parameters between the two matrices
COV_GCsp_first = inv(FISH_GCsp);
COV_XC_first = inv(FISH_XC);
COV_GCsp = COV_GCsp_first(1:N,1:N);
COV_XC = COV_XC_first(1:N,1:N);
% Invert to get Fisher matrix
FISH_sp = inv(COV_GCsp);
FISH_xc = inv(COV_XC);
% Diagonalize
[V1,D1] = eig(FISH_sp);
[V2,D2] = eig(FISH_xc);
% Build phi matrix
% V2 corresponds to eigen vectors of FISH_xc
phiB_bar = V2*diag(diag(D2.^(-0.5)));
% DEBUG : check identity matrix => OK, Identity matrix found !
id = (phiB_bar')*FISH_xc*phiB_bar
% phi matrix
barA = (phiB_bar')*FISH_sp*phiB_bar
[phiA, vA] = eig(barA);
phi = phiB_bar*phiA;
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues found !
FISH_sp*V1./V1
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues found !
FISH_xc*V2./V2
% Check if phi diagolize FISH_sp : NOT OK, not identical eigenvalues
FISH_sp*phi./phi
% Check if phi diagolize FISH_sp : NOT OK, not identical eigenvalues
FISH_xc*phi./phi
所以,我没有发现特征向量矩阵 Phi
使 A 和 B 对角化,因为预期的特征值不是相同值的列。
顺便说一下,我发现特征值 D1
和 D2
来自 :
[V1,D1] = eig(FISH_sp);
[V2,D2] = eig(FISH_xc);
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues D1 found !
FISH_sp*V1./V1
% Check eigen values : OK, columns of eigenvalues D2 found !
FISH_xc*V2./V2
我该如何解决这个错误的结果(我说的是比率:
FISH_sp*phi./phi
FISH_xc*phi./phi
FISH_sp
和 FISH_xc
的给定列不提供相同的值)
)
??在论文中,他们说 phi
使 A=FISH_sp
和 B=FISH_xc
对角化,但我无法重现它。
如果有人能看到我的错误在哪里...
您定义了 barA = inv(phiB_bar)*FISH_sp*phiB_bar
。从等式。 (39) 在手稿中它看起来应该是 barA = transpose(phiB_bar)*FISH_sp*phiB_bar
而不是。
此外,当 B
是单数时,您的方法 1 失败(不存在逆)。但是,MATLAB 的 eig(A,B)
也应该处理单数 B
,如果我没记错的话。