pygraphviz 布局 IOerror

Question

我尝试使用 pygraphviz 打印图表。我运行以下代码并得到以下错误。代码：

import pygraphviz as pgv

G=pgv.AGraph("k5_attributes.dot")
G.layout(prog = 'neato')
G.draw('file.png')

错误：

Traceback (most recent call last):
  File "./test.py", line 22, in <module>
    G.layout(prog = 'neato')
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pygraphviz/agraph.py", line 1359, in layout
    data = self._run_prog(prog, ' '.join([args, "-T", fmt]))
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pygraphviz/agraph.py", line 1336, in _run_prog
    raise IOError(b"".join(errors))
IOError: /usr/bin/neato: Symbol `MemTest' has different size in shared     object, consider re-linking

我安装了 pydot、matplotlib、pygraphviz、numpy、python-devel、cairocffi。

如果有人知道问题出在哪里，谢谢

Answer 1

错误信息是说当程序运行 /usr/bin/neato (具体来说 /usr/bin/neato -Tpng ... neato 有问题。"neato" 是 "graphviz" 的一部分。

您可以通过运行验证这一点：

neato -Tpng k5_attributes.dot -o example.png

您可能会收到相同的消息：

Symbol `MemTest' has different size in shared     object, consider re-linking

通常您可以通过卸载 "graphviz" 然后重新安装来解决这个问题。这将导致事物重新链接。但为了安全起见，我也会先卸载 pygraphviz，然后在安装 "graphviz" 之后重新安装。

pygraphviz 布局 IOerror

pygraphviz layout IOerror

python

pygraphviz