如何从多个 lavaan 模型中提取一个特定系数？

Question

我一次为运行多个 lavaan 模型编写了一个函数（来自 5 个不同的数据集）。在输出中我得到了 5 个不同的输出。但是，我想从这些模型中的每一个中提取一个具体的估计，因为我在荟萃分析中使用它们（而且我有更多的模型）

这是我的运行模型代码：

df_list <- list ('Y1'=emo_dyn_1,'Y2'=emo_dyn_2,'Y3'=emo_dyn_3,'Y4'=emo_dyn_4,'Y5'=emo_dyn_5)

model <- 'DepB ~ isdNA + imeanNA + sex + age'

fun = function(emo_dyn){
  fit=sem(model,
          data=emo_dyn,
          estimator = "MLR", 
          missing = "ml.x")
  summ = summary(fit, standardized = TRUE)
  
  list(fit = fit,summary = summ)
  
}

results <- lapply(df_list,fun)
names(results) <- names(df_list)
results

这就是我提取系数的方式。它有点使它成为一个数据框，然后我从中提取特定的值。不确定这是否是最佳选择。它是关于特定路径的标准化估计。但它只是复制和粘贴，我相信这会更容易，但我不知道如何编写这个循环。

emo_dyn_1_est<-standardizedSolution(results$Y1$fit) # Standardised coefficients
emo_dyn_1_est_1<-emo_dyn_1_est[1, 4]
emo_dyn_1_est_1

emo_dyn_2_est<-standardizedSolution(results$Y2$fit) # Standardised coefficients
emo_dyn_2_est_2<-emo_dyn_2_est[1, 4]
emo_dyn_2_est_2

emo_dyn_3_est<-standardizedSolution(results$Y3$fit) # Standardised coefficients
emo_dyn_3_est_3<-emo_dyn_3_est[1, 4]
emo_dyn_3_est_3

emo_dyn_4_est<-standardizedSolution(results$Y4$fit) # Standardised coefficients
emo_dyn_4_est_4<-emo_dyn_4_est[1, 4]
emo_dyn_4_est_4

emo_dyn_5_est<-standardizedSolution(results$Y5$fit) # Standardised coefficients
emo_dyn_5_est_5<-emo_dyn_5_est[1, 4]
emo_dyn_5_est_5

Answer 1

lavaan 具有 parameterEstimates 功能，因此您可以执行以下操作：

df_list <- list ('Y1'=emo_dyn_1,'Y2'=emo_dyn_2,'Y3'=emo_dyn_3,'Y4'=emo_dyn_4,'Y5'=emo_dyn_5)

model <- 'DepB ~ isdNA + imeanNA + sex + age'

fun <- function(emo_dyn){
  fit <- sem(model,
          data=emo_dyn,
          estimator = "MLR", 
          missing = "ml.x")
  
  fit
}

results <- lapply(df_list,fun)
names(results) <- names(df_list)

## Get a specific parameter
get_param <- function(fit, coef_pos) {
    param <- parameterEstimates(fit, standardized = TRUE)[coef_pos, "std.lv"]
    param
}

lapply(results, get_param, coef_pos = 1)

我做了一项更改：在您的 lapply 中，为了获得结果，我只保持模型适合。如果你想要所有的摘要，你可以 lapply(results, summary)。 get_param 函数假定您知道所需参数在结果 table 中的位置。

如果您想保留现有的 lapply 结果，那么这样的事情会起作用：

results_fit_only <- lapply(results, "[[", "fit")
lapply(results_fit_only, get_param, coef_pos = 1)

如何从多个 lavaan 模型中提取一个特定系数？

How can I extract one specific coefficient from multiple lavaan models?

parameters

loops

r

extract

r-lavaan