mpirun 是否需要指定 -np？
Does mpirun require -np to be specified?
我曾经运行喜欢
mpirun -np N ./c_or_python_script
但是，在具有 PBS 作业提交队列的集群上（我不知道这种类型的提交叫什么），示例脚本不要求这个 -np N 参数！我还是给了。有什么不同？我在下面的集群中指定了一个模拟示例脚本。
#!/bin/sh
#PBS -V
#PBS -N mpi_job
#PBS -q normal
#PBS -A etc
#PBS -l select=4:ncpus=64:mpiprocs=64
#PBS -l walltime=04:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun ./test_mpi.exe
如果我改成 mpirun -np 256 ./test_mpi.exe 会有什么变化？
谢谢。我不是这方面的专家。
P.S。在bsub提交系统中，我理解了其中的区别。
这取决于您使用的 MPI 实现以及它与资源管理器集成的程度。例如，Open MPI 与许多此类资源管理器紧密集成，包括 PBS、LSF、SLURM 等。当 运行 在批处理作业中时，它会自动发现分配的详细信息并启动与分配的 CPU 槽数一样多的进程，除非您用 -np 另行告诉它。在您的在这种情况下，您要求 4 个节点，每个节点有 64 个 CPU 个插槽，总共有 256 个 CPU 个插槽，因此传递 -np 256 没有任何改变。如果您要求 MPI 启动较少的进程，例如使用 -np 128，那么一些 CPU 槽将保持未使用状态。如果您要求更多进程，例如，使用 -np 300，那么 Open MPI 通常会抱怨并拒绝 运行 程序，除非您使用 -oversubscribe 显式启用超额订阅，这可能不是资源管理器或集群管理员的喜好。其他 MPI 实现以类似的方式工作。
我曾经运行喜欢
mpirun -np N ./c_or_python_script
但是，在具有 PBS 作业提交队列的集群上（我不知道这种类型的提交叫什么），示例脚本不要求这个 -np N 参数！我还是给了。有什么不同？我在下面的集群中指定了一个模拟示例脚本。
#!/bin/sh
#PBS -V
#PBS -N mpi_job
#PBS -q normal
#PBS -A etc
#PBS -l select=4:ncpus=64:mpiprocs=64
#PBS -l walltime=04:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun ./test_mpi.exe
如果我改成 mpirun -np 256 ./test_mpi.exe 会有什么变化？
谢谢。我不是这方面的专家。
P.S。在bsub提交系统中，我理解了其中的区别。
这取决于您使用的 MPI 实现以及它与资源管理器集成的程度。例如，Open MPI 与许多此类资源管理器紧密集成，包括 PBS、LSF、SLURM 等。当 运行 在批处理作业中时，它会自动发现分配的详细信息并启动与分配的 CPU 槽数一样多的进程，除非您用 -np 另行告诉它。在您的在这种情况下，您要求 4 个节点，每个节点有 64 个 CPU 个插槽，总共有 256 个 CPU 个插槽，因此传递 -np 256 没有任何改变。如果您要求 MPI 启动较少的进程，例如使用 -np 128，那么一些 CPU 槽将保持未使用状态。如果您要求更多进程，例如，使用 -np 300，那么 Open MPI 通常会抱怨并拒绝 运行 程序，除非您使用 -oversubscribe 显式启用超额订阅，这可能不是资源管理器或集群管理员的喜好。其他 MPI 实现以类似的方式工作。