如何在不重复治疗的情况下使用 Rstudio 在五个区块中随机化治疗？

Question

在果园实验中，有5个处理，5个街区。为了分析处理对树木和果实生长的影响，中间树行两侧的处理相同。我怎样才能随机化 R 中的治疗，而不是让一个块的最后一个治疗与下一个块的开始治疗相同。例如，我使用 agricolae 包在其块内随机化处理，但我得到这样的随机化：

Block 1: 3 1 5 2 4 
Block 2: 2 3 4 5 1
Block 3: 2 5 1 4 3 
Block 4: 1 5 3 4 2
Block 5: 2 3 1 5 4

如您所见，块 4 以处理 2 结束，然后块 5 从处理 2 开始。我想尽可能避免这种情况，但我不确定如何在 r 中做到这一点。

实验的直观表示，其中处理未在其图中随机化：

运行下面的解决方法，我遇到了新的table不显示数字的问题。

Print screen of the command dput(head(data,20))

Answer 1

假设您的数据如下所示：

head(data,10)
#     Block TreeMiddleRow
#1  Block 1   Treatment 1
#2  Block 1   Treatment 2
#3  Block 1   Treatment 3
#4  Block 1   Treatment 4
#5  Block 1   Treatment 5
#6  Block 2   Treatment 1
#7  Block 2   Treatment 2
#8  Block 2   Treatment 3
#9  Block 2   Treatment 4
#10 Block 2   Treatment 5

您可以使用 while 循环继续按组重新采样，直到 none 个块边界彼此相等：

treatments <- rep("Tretment",nrow(data))
while(any(treatments[head(cumsum(rle(data$Block)$lengths),-1)] == treatments[head(cumsum(rle(data$Block)$lengths),-1)+1])){
  treatments <<- unname(unlist(tapply(data$TreeMiddleRow,
                                      data$Block,
                                      FUN = function(x) sample(x,size = 5, replace = FALSE))))
}
data$TreeMiddleRow <- treatments
head(data,10)
#     Block TreeMiddleRow
#1  Block 1   Treatment 2
#2  Block 1   Treatment 3
#3  Block 1   Treatment 4
#4  Block 1   Treatment 5
#5  Block 1   Treatment 1
#6  Block 2   Treatment 2
#7  Block 2   Treatment 5
#8  Block 2   Treatment 3
#9  Block 2   Treatment 4
#10 Block 2   Treatment 1

请注意 cumsum 和 rle 允许我们 return 块之间的边界索引。 head(x,-1) 删除最后一个，因为我们不关心它：

head(cumsum(rle(data$Block)$lengths),-1)
#[1]  5 10 15 20

示例数据：

data <- data.frame(Block = rep(paste("Block",1:5),each = 5),
                   TreeMiddleRow = rep(paste("Treatment",1:5),times = 5))

如何在不重复治疗的情况下使用 Rstudio 在五个区块中随机化治疗？

How to randomise treatments in five blocks using Rstudio without a treatment being repeated?

r

experimental-design

heap-randomization