创建一个代表网络连接的 Numpy 数组

Question

假设我有一个描述节点间网络链接的数组：

array([[ 1.,  2.],
       [ 2.,  3.],
       [ 3.,  4.]])

这将是一个线性 4 节点网络，具有从节点 1 到节点 2 的链接，依此类推..

将此信息转换为以下格式的数组的最佳方法是什么？

array([[ 0.,  1.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  1.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.]])

然后列号代表 "to nodes"，行号代表 "from nodes"。

另一个例子是：

array([[ 1.,  2.],
       [ 2.,  3.],
       [ 2.,  4.]])

给予

array([[ 0.,  1.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  1.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.]])

Answer 1

节点 ID 应该是整数。另外numpy中的行和列都是从零开始编号的，所以我们要在每个维度上减一：

import numpy as np

conns = np.array([[ 1,  2],
                  [ 2,  3],
                  [ 3,  4]])
net = np.zeros((conns.max(), conns.max()), dtype=int)

# two possibilities:

# if you need the number of connections:
for conn in conns:
    net[conn[0]-1, conn[1]-1] += 1

# if you just need a 1 for existing connection(s):
net[conns[:,0]-1, conns[:,1]-1] = 1

创建一个代表网络连接的 Numpy 数组

Create a Numpy array representing connections in a network

python

arrays

numpy