Rcpp 函数导致包崩溃
Rcpp functions cause crash in package
我有一个包,https://github.com/tfrostig/RSEE,其中包含一些 (3) RcppArmadillo 函数。该软件包在其他计算机上运行良好。当我构建包时没有出现错误,但是每当我调用任何 RCPP 函数时它都会导致 R 崩溃。
当我尝试使用单元测试时,出现错误:“退出状态为 -1073741819”。
如果我使用 Rcpp::sourceCpp()
然后调用函数,一切正常。其他带有 Rcpp 函数的包也能正常工作。
例如:
`// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>
using namespace Rcpp;
using namespace arma;
// [[Rcpp::export]]
arma::mat localRegression(arma::mat weightmat, arma::mat modelmat, arma::vec xtemp) {
return inv(modelmat.t() * weightmat * modelmat) * modelmat.t() * weightmat * xtemp;
}
使用RSEE:::localRegression
会导致崩溃。如果我使用 sourceCpp
加载源代码然后调用 localRegression
它工作正常。
什么会导致此类问题?
The session info is:
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 19042)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_Israel.1252 LC_CTYPE=English_Israel.1252 LC_MONETARY=English_Israel.1252
[4] LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_Israel.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] RSEE_0.1.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.0.3 tools_4.0.3 Rcpp_1.0.6
查看您的包裹,我假设错误和崩溃来自 src/RCPP_LOWESS.cpp
中的 arma::mat iterLowess(..., double epsmed = 10^(-6)) {
。请注意,^
不是 Cpp 中的幂运算,而是 byte XOR
operation。此外,10
是一个整数,而 10.0
是一个双精度数,因此虽然编译器“应该”进行自动转换,但它可能会失败。
举个例子
library(Rcpp)
f <- cppFunction('double powww(double x = 10^(-6)){
double y = x^2;
return y;}')
你会注意到这会引发错误。
几乎不可能给你一个确切的答案,因为我们在这个问题上的信息非常有限,但既然你提到它在调用函数时立即崩溃(我假设它在调试状态下这样做,因为好吧)我们应该查看错误的函数定义。
我有一个包,https://github.com/tfrostig/RSEE,其中包含一些 (3) RcppArmadillo 函数。该软件包在其他计算机上运行良好。当我构建包时没有出现错误,但是每当我调用任何 RCPP 函数时它都会导致 R 崩溃。
当我尝试使用单元测试时,出现错误:“退出状态为 -1073741819”。
如果我使用 Rcpp::sourceCpp()
然后调用函数,一切正常。其他带有 Rcpp 函数的包也能正常工作。
例如:
`// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>
using namespace Rcpp;
using namespace arma;
// [[Rcpp::export]]
arma::mat localRegression(arma::mat weightmat, arma::mat modelmat, arma::vec xtemp) {
return inv(modelmat.t() * weightmat * modelmat) * modelmat.t() * weightmat * xtemp;
}
使用RSEE:::localRegression
会导致崩溃。如果我使用 sourceCpp
加载源代码然后调用 localRegression
它工作正常。
什么会导致此类问题?
The session info is:
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 19042)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_Israel.1252 LC_CTYPE=English_Israel.1252 LC_MONETARY=English_Israel.1252
[4] LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_Israel.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] RSEE_0.1.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.0.3 tools_4.0.3 Rcpp_1.0.6
查看您的包裹,我假设错误和崩溃来自 src/RCPP_LOWESS.cpp
中的 arma::mat iterLowess(..., double epsmed = 10^(-6)) {
。请注意,^
不是 Cpp 中的幂运算,而是 byte XOR
operation。此外,10
是一个整数,而 10.0
是一个双精度数,因此虽然编译器“应该”进行自动转换,但它可能会失败。
举个例子
library(Rcpp)
f <- cppFunction('double powww(double x = 10^(-6)){
double y = x^2;
return y;}')
你会注意到这会引发错误。
几乎不可能给你一个确切的答案,因为我们在这个问题上的信息非常有限,但既然你提到它在调用函数时立即崩溃(我假设它在调试状态下这样做,因为好吧)我们应该查看错误的函数定义。