安装 R 包时覆盖特定的编译器标志

Question

我有一个 R 脚本试图安装许多包（省略了所有但只显示一个）：

install.packages("zoo")

那我运行

Rscript my_r.r

然后，我注意到它会尝试编译一些 C 代码：

gcc -m64 -std=gnu99 -I"/usr/include/R" -DNDEBUG -I../inst/include -I"/latest/rsg_comm/r_packages/zoo/include" -I/usr/local/include  -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches   -m64 -mtune=generic  -c any.c -o any.o

有没有办法让所有包在本地编译 -O3 和 -mtune=native？

我注意到有一个 similar post 建议使用 ~/R/.Makevars。不过好像

它将覆盖所有编译器标志，而不仅仅是我指定的那些 2 个。有办法指定吗？
我要下载每个源的源码包，还不如直接用install.packages("package_name")方便，会算最新版本，还要通过镜像等。或者有方便的方式？

Answer 1

您可以编辑 .R/Makevars 文件并使用 += 运算符附加所需的标志，例如

CFLAGS+= -O3 -Wall -mtune=native -march=native

如您在下面的评论中所说，如果存在冲突，则使用后一个标志。在从源代码编译方面，您可以通过 install.packages() 执行此操作，例如

install.packages("package_name", type = "source")

安装 R 包时覆盖特定的编译器标志

Override Specific Compiler Flags When Installing R Packages

r

rscript

install.packages