如何在 FiPy 中隐式表示二次依赖于因变量的项
How to implicitly represent a term in FiPy that is quadratically dependent on the dependent variable
我正在尝试使用 FiPy 为多组分反应扩散系统建模。每个组分 \phi_i 都有一个扩散项和多个双分子反应项(\phi_m、\phi_n)。每个组件的时间演化由以下等式给出:
\frac{d\phi_i}{dt} = D_i\nabla \phi_i + \sum_{m,n} k_{m,n}\phi_m \phi_n ,
我在 FiPy 中表示为
eq = TransientTerm() == DiffusionTerm(D_i) + ReactionTerm
哪里
if i!=m and i!=n: ReactionTerm = k_mn * \phi_m * phi_n
elif i==m and i!=n: ReactionTerm = ImplicitSourceTerm(k_mn * \phi_n)
elif i!=m and i==n: ReactionTerm = ImplicitSourceTerm(k_mn * \phi_m)
在 i==m==n 的情况下如何表示 ReactionTerm?换句话说,如何以二次方式表示一项取决于要求解的变量,如以下等式所示:
\frac{d\phi_i}{dt} = \phi_i \cdot \phi_i
直到现在,我一直在明确表示它,但我想知道是否有一种方法可以像我对其他项(包括要求解的组件)所做的那样隐式表示它。
在所有情况下,隐含性都是线性的。 ImplicitSourceTerm(coeff=k_mn * phi_i)
就行了。
在所有情况下,您都需要 sweep 非线性,无论它们来自解变量中的二次项还是对其他解变量的依赖性。
我正在尝试使用 FiPy 为多组分反应扩散系统建模。每个组分 \phi_i 都有一个扩散项和多个双分子反应项(\phi_m、\phi_n)。每个组件的时间演化由以下等式给出:
\frac{d\phi_i}{dt} = D_i\nabla \phi_i + \sum_{m,n} k_{m,n}\phi_m \phi_n ,
我在 FiPy 中表示为
eq = TransientTerm() == DiffusionTerm(D_i) + ReactionTerm
哪里
if i!=m and i!=n: ReactionTerm = k_mn * \phi_m * phi_n
elif i==m and i!=n: ReactionTerm = ImplicitSourceTerm(k_mn * \phi_n)
elif i!=m and i==n: ReactionTerm = ImplicitSourceTerm(k_mn * \phi_m)
在 i==m==n 的情况下如何表示 ReactionTerm?换句话说,如何以二次方式表示一项取决于要求解的变量,如以下等式所示:
\frac{d\phi_i}{dt} = \phi_i \cdot \phi_i
直到现在,我一直在明确表示它,但我想知道是否有一种方法可以像我对其他项(包括要求解的组件)所做的那样隐式表示它。
在所有情况下,隐含性都是线性的。 ImplicitSourceTerm(coeff=k_mn * phi_i)
就行了。
在所有情况下,您都需要 sweep 非线性,无论它们来自解变量中的二次项还是对其他解变量的依赖性。