栅格化错误栏时的丑陋轮廓

Question

我正在使用 Matplotlib（版本 2.2.5）绘制大量有错误的数据点，并且我正在栅格化数据，因为有几千个数据点。然而，我发现当我将数据栅格化并另存为 PDF 时，错误栏会产生一个难看的白色轮廓，这是不可接受的。我构建了一个显示问题的 MWE：

import numpy as np
import random as rand
import matplotlib.pyplot as plt

rand.seed(10)
seeds = range(0, 1000)
data = np.empty((len(seeds), 2))
for n in seeds:
    data[n, 0] = rand.gauss(1, 0.01)
    data[n, 1] = rand.gauss(1, 0.01)

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6))

ax.scatter(data[:, 0], data[:, 1], s=10, facecolors="k", rasterized=True, zorder=1)
ax.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], xerr=0.01, yerr=0.01, color="k", fmt="none", rasterized=True, zorder=2)

fig.savefig("Test.pdf", dpi=250)

这在 Jupyter Notebook 输出中以及保存的 PNG 文件中看起来都不错。然而，输出的 PDF 文件看起来像这样：我如何摆脱错误栏引起的白色绒毛？如果我不光栅化，问题就消失了，但是文件加载到我的论文中需要很长时间，我最不想做的就是惹恼我的 reader.

Answer 1

感谢，我找到了解决方案：我需要将 ax.set_rasterization_zorder(0) 添加到代码中，并将绘制点的 zorder 更改为低于 0。这产生了一个完美的图形，没有丑陋的数据轮廓并保留矢量化轴，这正是我想要的。工作代码是：

import numpy as np
import random as rand
import matplotlib.pyplot as plt

rand.seed(10)
seeds = range(0, 1000)
data = np.empty((len(seeds), 2))
for n in seeds:
    data[n, 0] = rand.gauss(1, 0.01)
    data[n, 1] = rand.gauss(1, 0.01)

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6))

ax.scatter(data[:, 0], data[:, 1], s=10, facecolors="k", rasterized=True, zorder=-2)
ax.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], xerr=0.01, yerr=0.01, color="k", fmt="none", rasterized=True, zorder=-1)

ax.set_rasterization_zorder(0)

fig.savefig("Test.pdf", dpi=250)

输出为：

栅格化错误栏时的丑陋轮廓

Ugly Outline When Rasterizing Errorbar

python

matplotlib

rasterizing

errorbar

savefig