如何根据另一列（Rstudio）的唯一名称计算列的一部分的中位数？

Question

我有一个包含 4 列（不包括行名）和 >1200 行的数据框。

(unique cell ID; rownames)	Sample ID	ME.brown	ME.turquoise	ME.blue
p1t1_bcHTNA	p1t1	-0.004	0.0023	0.00683
p1t1_bcHNVA	p1t1	0.0054	-0.0123	0.0045
p1t2_bcEZOJ	p1t2	-0.0022	0.00354	0.00374
K3-B003528	LT_S58	0.0464	0.00734	-0.0013

我有 > 1200 个唯一的细胞 ID，总共对应 68 个样本（样本 ID）。现在，我想要做的是计算每个样本的每个 ME（棕色、绿松石色和蓝色）的中值。所以理想情况下，我希望最终得到一个包含 68 行（对于每个唯一样本）和 3 列（对于每个 ME 中位数）的 table。除了手动对 68 个独特样本中的每一个进行子集化之外，我不知道该怎么做，这效率不高。

我将不胜感激。

体重

Answer 1

您可以使用 dplyr 的 group_by 和 summarise 函数执行此操作：

library(dplyr)

iris %>% 
   group_by(Species) %>%  
   summarise_all(.funs = median)

Answer 2

aggregate 来自 base R

的选项

aggregate(.~ Species, iris, median)

如何根据另一列（Rstudio）的唯一名称计算列的一部分的中位数？

How to calculate the median for a part of a column based on unique names from another column (Rstudio)?

r

function

dataframe

median