R randomForestSRC：如何提取（或计算）解释的方差？

Question

假设我有一个来自 rfsrc(..)（randomForestSRC 包）调用的对象“数据库”。调用 database 给我（在我的特殊情况下）

                         Sample size: 13209
                     Number of trees: 5000
           Forest terminal node size: 5
       Average no. of terminal nodes: 1890.76
No. of variables tried at each split: 20
              Total no. of variables: 58
       Resampling used to grow trees: swor
    Resample size used to grow trees: 8348
                            Analysis: RF-R
                              Family: regr
                      Splitting rule: mse *random*
       Number of random split points: 10
                % variance explained: 40.6
                          Error rate: 43.9

我正在寻找一个将精确的“解释的方差百分比”提取到变量中的命令。类似于（虚构的）varEx <- database$variance[1,2] 或 varEx <- rfsrc.explVar(database)。目前，capture.output() 是一个快速而肮脏的选择，但我想一定有一个正确的方法。

有什么想法吗？那太好了！

顺便说一句：对于来自 randomForest(..)（randomForest 包）调用的“数据库”，同样有趣（虽然目前并不紧急）。

Answer 1

我在 randomForestSRC::print.rfsrc!

中找到了公式

由于您将“regr”作为系列，解释的方差百分比公式为：

per.var <- round(100 * (1 - err.rate[nrow(err.rate),]/var(x$yvar, na.rm = TRUE)), 2)

希望对你有所帮助。

R randomForestSRC：如何提取（或计算）解释的方差？

R randomForestSRC: how to extract (or calculate) the variance explained?

r

random-forest