使用 ggplot 制作热图以不正确的顺序放置图块

Question

这可能是由于一些愚蠢的错误，但我已经能够为我最初的问题生成一个代表，所以希望有人能提供帮助。

我的目标是创建相关图上三角形的热图，但是当将数据变长并在 NA 值未在顶部创建漂亮三角形的地方绘制时会发生一些事情。

我试过将变量转换为因子并手动设置轴中断，但无法找出问题所在。提前致谢！

代表代码：

fake.cor <- cor(iris[,1:4])
fake.cor[upper.tri(fake.cor)] <- NA
#get in long form
fake.cor.df <- data.frame(fake.cor,
                             var1 = row.names(fake.cor)) %>%
  reshape2::melt(variable.name = "var2" , value.name = "spearman") %>%
  mutate_at(vars(var1, var2), function(x) factor(x, levels = c("Petal.Length", "Petal.Width", "Sepal.Length", "Sepal.Width")))


ggplot(fake.cor.df, aes(x = var1, y = var2, fill = spearman)) +
  geom_tile() +
  scale_x_discrete(breaks = c("Petal.Length", "Petal.Width", "Sepal.Length", "Sepal.Width")) +
  scale_y_discrete(breaks = c("Sepal.Width", "Sepal.Length", "Petal.Width", "Petal.Length"))

Answer 1

要手动设置 factor 列的顺序，您需要正确设置级别

fake.cor.df <- data.frame(fake.cor,
  var1 = row.names(fake.cor)) %>%
  reshape2::melt(variable.name = "var2" , value.name = "spearman") %>%
  mutate(var1 =  factor(var1, levels = rev(c("Sepal.Length", "Sepal.Width", "Petal.Length", "Petal.Width"))),
    var2 = factor(var2, levels = rev(levels(var1))))


ggplot(fake.cor.df, aes(x = var1, y = var2, fill = spearman)) +
  geom_tile()

输出

使用 ggplot 制作热图以不正确的顺序放置图块

Using ggplot to make a heatmap places tiles in incorrect order

r

heatmap

ggplot2