Seurat 元数据的特征图

Question

假设我有一个名为 seur 的 Seurat 对象，其元数据包括一个名为“count”（双精度列表）的列，该列显示某个单元格出现的次数。我想使用 FeaturePlot 工具在我的 UMAP 上绘制计数，这样我就可以通过颜色渐变查看高计数的位置。

然而，当我这样做时：

FeaturePlot(seur, features = "count")

我收到错误：

count.Error in if (unique.feature.exp == 0) { : 
 missing value where TRUE/FALSE needed

如何解决这个错误 and/or 正确使用 FeaturePlot？

Answer 1

应该可以，检查你有 Seurat 3 或 Seurat 4，我正在使用下面的 Seurat_3.2.2:

library(Seurat)
seur = pbmc_small
eur$count = rpois(ncol(seur),5)
FeaturePlot(seur,features="count")