能否获得 R 的 TidyModel 框架中随机森林模型的袋外误差?
Can the out of bag error for a random forests model in R's TidyModel's framework be obtained?
如果直接使用ranger函数,可以从生成的ranger class对象中获取out-of-bag错误。
如果相反,通过设置配方、模型 specification/engine、调整参数等方式进行,我们如何提取相同的错误? Tidymodels 方法似乎无法保留该数据。
如果你想访问 parsnip 对象内部的 ranger 对象,它就在那里 $fit
:
library(tidymodels)
data("ad_data", package = "modeldata")
rf_spec <-
rand_forest() %>%
set_engine("ranger", oob.error = TRUE) %>%
set_mode("classification")
rf_fit <- rf_spec %>%
fit(Class ~ ., data = ad_data)
rf_fit
#> parsnip model object
#>
#> Fit time: 158ms
#> Ranger result
#>
#> Call:
#> ranger::ranger(x = maybe_data_frame(x), y = y, oob.error = ~TRUE, num.threads = 1, verbose = FALSE, seed = sample.int(10^5, 1), probability = TRUE)
#>
#> Type: Probability estimation
#> Number of trees: 500
#> Sample size: 333
#> Number of independent variables: 130
#> Mtry: 11
#> Target node size: 10
#> Variable importance mode: none
#> Splitrule: gini
#> OOB prediction error (Brier s.): 0.1340793
class(rf_fit)
#> [1] "_ranger" "model_fit"
class(rf_fit$fit)
#> [1] "ranger"
rf_fit$fit$prediction.error
#> [1] 0.1340793
由 reprex package (v1.0.0)
于 2021 年 3 月 11 日创建
如果直接使用ranger函数,可以从生成的ranger class对象中获取out-of-bag错误。
如果相反,通过设置配方、模型 specification/engine、调整参数等方式进行,我们如何提取相同的错误? Tidymodels 方法似乎无法保留该数据。
如果你想访问 parsnip 对象内部的 ranger 对象,它就在那里 $fit
:
library(tidymodels)
data("ad_data", package = "modeldata")
rf_spec <-
rand_forest() %>%
set_engine("ranger", oob.error = TRUE) %>%
set_mode("classification")
rf_fit <- rf_spec %>%
fit(Class ~ ., data = ad_data)
rf_fit
#> parsnip model object
#>
#> Fit time: 158ms
#> Ranger result
#>
#> Call:
#> ranger::ranger(x = maybe_data_frame(x), y = y, oob.error = ~TRUE, num.threads = 1, verbose = FALSE, seed = sample.int(10^5, 1), probability = TRUE)
#>
#> Type: Probability estimation
#> Number of trees: 500
#> Sample size: 333
#> Number of independent variables: 130
#> Mtry: 11
#> Target node size: 10
#> Variable importance mode: none
#> Splitrule: gini
#> OOB prediction error (Brier s.): 0.1340793
class(rf_fit)
#> [1] "_ranger" "model_fit"
class(rf_fit$fit)
#> [1] "ranger"
rf_fit$fit$prediction.error
#> [1] 0.1340793
由 reprex package (v1.0.0)
于 2021 年 3 月 11 日创建