rpy2 中的 R maptools wrld_simpl

Question

在 R 中：

import(maptools)
data(wrld_simpl)

在 python rpy2 中，如何访问 wrld_simpl？以下代码（在 Python 中）失败如下...package "maptools" has no attribute wrld_simpl

maptools = importr('maptools')
data = DataFrame(maptools.wrld_simpl)

只是想了解 rpy2（并重温大学时代的 R）

Answer 1

使用rpy2.robjects.packages.data，如rpy2 introduction:

所示

>>> from rpy2.robjects.packages import importr, data

>>> maptools = importr('maptools')
>>> spatial_df_r = data(maptools).fetch('wrld_simpl')['wrld_simpl']
>>> spatial_df_r
<rpy2.robjects.methods.RS4 object at 0x7ffa932b0cc0> [RTYPES.S4SXP]
R classes: ('SpatialPolygonsDataFrame',)

您似乎也在尝试将数据转换为 pandas.DataFrame。一个小问题是数据不是数据框，而是一个 SpatialPolygonsDataFrame 对象。但是，您可以将其转换为适当的 data.frame:

>>> base = importr('base')
>>> df_r = base.as_data_frame(spatial_df_r)
>>> tuple(df_r.rclass)
('data.frame',)

然后到pandas DataFrame:

from rpy2.robjects import conversion
from rpy2.robjects import default_converter, pandas2ri

with conversion.localconverter(default_converter + pandas2ri.converter):
    df = conversion.rpy2py(df_r)

其中 df 现在是一个 pandas DataFrame:

>>> type(df)
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>

但是，如果您使用的是 Jupyter，则可以使用 rpy2 magic 的 -o 选项更轻松地完成转换，请参阅：using rpy2 in notebooks and rpy2.ipython.rmagic。

rpy2 中的 R maptools wrld_simpl

R maptools wrld_simpl in rpy2

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