批量重命名 Linux Shell 中的文件

Question

我在远程集群上通过 ssh 工作，需要根据方案重命名一些文件。重命名应该像这样：

M-19-3778_P1-DX5-K47-232-Elev_A1-A1_L001_R1_001.fastq.gz变成
M-19-3778-P1-DX5-K47-232-Elev-A1-A1L001_R1.R.fq.gz

M-19-3778_P1-DX5-K47-232-Elev_A1-A1_L001_R2_001.fastq.gz变成
M-19-3778-P1-DX5-K47-232-Elev-A1-A1L001_R1.F.fq.gz

M-19-3779_P1-F48-F37-86-Cont_A2-A2_L001_R1_001.fastq.gz变成
M-19-3779-P1-F48-F37-86-Cont-A2-A2L001_R2.R.fq.gz

M-19-3779_P1-F48-F37-86-Cont_A2-A2_L001_R2_001.fastq.gz变成
M-19-3779-P1-F48-F37-86-Cont-A2-A2L001_R2.F.fq.gz

...

M-19-3830_P1-DX5-D12-221-Elev_F9-F9_L001_R1_001.fastq.gz变成
M-19-3830-P1-DX5-D12-221-Elev-F9-F9L001_R53.R.fq.gz

M-19-3830_P1-DX5-D12-221-Elev_F9-F9_L001_R2_001.fastq.gz变成
M-19-3830-P1-DX5-D12-221-Elev-F9-F9L001_R53.F.fq.gz

迭代仅在名称的开头以 3778....

到目前为止，我已经尝试过 grep/sed/cat 的组合，但没有成功。而且我不知道如何处理名称 R1、R2、...末尾的迭代，我的猜测是 for 循环和 if-声明，但我就是不明白这个运行。

如有任何帮助，我将不胜感激！

Answer 1

i=1
for name in *
do
    newName=${name%_L001_R1_001.fastq.gz}L001_R$i.R.fq.gz
    mv "$name" "$oldname"
    ((i++))
done

Batch Renaming of Files in Linux Shell