NDlib 独立级联初始化给我一个错误
NDlib Independent Cascade initialisation is giving me an error
我正在使用 NDlib 尝试在图形上模拟独立级联扩散过程。我正在尝试使用 config.add_model_parameter('Infected', {0, 10, 100})
设置一些初始种子节点(此时我的其余代码与找到的教程示例相同 here)但是我收到错误 UserWarning: Initial infection missing: a random sample of 5% of graph nodes will be set as infected warnings.warn('Initial infection missing: a random sample of 5% of graph nodes will be set as infected')
当我然后 运行 行 model.set_initial_status(config)
。我不确定这是怎么发生的,因为在链接的文档中它说初始感染状态可以通过两个选项定义,第一个选项是教程中使用的,第二个是我试图指定的。有谁知道为什么它似乎无法识别我的初始种子节点?
我使用的完整代码是这样的:
g = nx.erdos_renyi_graph(1000, 0.05, seed=1)
model = ep.IndependentCascadesModel(g)
config = mc.Configuration()
# config.add_model_parameter('fraction_infected', 0)
config.add_model_parameter('Infected', {0, 10, 100})
threshold = 0.01
for e in g.edges():
config.add_edge_configuration("threshold", e, threshold)
model.set_initial_status(config) # this line triggers the warning
对于 ndlib,你应该使用 add_model_initial_configuration
而不是 add_model_parameter
,请看这个例子:https://ndlib.readthedocs.io/en/latest/reference/mconf/Mconf.html#status-configuration
我正在使用 NDlib 尝试在图形上模拟独立级联扩散过程。我正在尝试使用 config.add_model_parameter('Infected', {0, 10, 100})
设置一些初始种子节点(此时我的其余代码与找到的教程示例相同 here)但是我收到错误 UserWarning: Initial infection missing: a random sample of 5% of graph nodes will be set as infected warnings.warn('Initial infection missing: a random sample of 5% of graph nodes will be set as infected')
当我然后 运行 行 model.set_initial_status(config)
。我不确定这是怎么发生的,因为在链接的文档中它说初始感染状态可以通过两个选项定义,第一个选项是教程中使用的,第二个是我试图指定的。有谁知道为什么它似乎无法识别我的初始种子节点?
我使用的完整代码是这样的:
g = nx.erdos_renyi_graph(1000, 0.05, seed=1)
model = ep.IndependentCascadesModel(g)
config = mc.Configuration()
# config.add_model_parameter('fraction_infected', 0)
config.add_model_parameter('Infected', {0, 10, 100})
threshold = 0.01
for e in g.edges():
config.add_edge_configuration("threshold", e, threshold)
model.set_initial_status(config) # this line triggers the warning
对于 ndlib,你应该使用 add_model_initial_configuration
而不是 add_model_parameter
,请看这个例子:https://ndlib.readthedocs.io/en/latest/reference/mconf/Mconf.html#status-configuration