使 CRAN R 包建议 GitHub R 包

Question

我想在我的 R 包中使用 GitHub 上可用的 R 包 BOLTSSIRR，我想将其上传到 CRAN。

我在 DESCRIPTION 文件的 Suggests: 下列出了 BOLTSSIRR，并使用 Additional_repositories: https://github.com/daviddaigithub/BOLTSSIRR 使 link 到 GitHub 可用。

然而，运行 R CMD check --as-cran 我得到：

Suggests or Enhances not in mainstream repositories:
  BOLTSSIRR
Availability using Additional_repositories specification:
  BOLTSSIRR   no   ?                                          
  ?            ?   https://github.com/daviddaigithub/BOLTSSIRR
Additional repositories with no packages:
  https://github.com/daviddaigithub/BOLTSSIRR

所以 GitHub link 似乎没有在检查中得到识别。我可能需要在这里更改一些内容吗？

Answer 1

如您所见，您不能在 CRAN 包中使用 Remotes。您需要做的是确保您所依赖的包的 .tar.gz 文件在某处可用。 Github 不会自动执行此操作，因为 https://github.com/daviddaigithub/BOLTSSIRR 未设置为包存储库。

解决方案是创建您自己的小型存储库，并在那里保留非 CRAN 包的副本。 drat 包（可在此处获取：https://github.com/eddelbuettel/drat) makes this easy as long as you have a Github account: follow the instructions here: https://github.com/drat-base/drat。总而言之：

将 https://github.com/drat-base/drat 分叉到您的帐户中，并将其克隆到您自己的计算机上。
在主分支中启用 Github 个包含 docs/ 文件夹的页面。
使用 remotes::install_github("eddelbuettel/drat") 将 drat 包安装到 R 中。（我假设这个版本最终会进入 CRAN；如果您使用当前的 CRAN 版本，说明会稍微复杂一些。）
构建您要插入的包。您需要源版本；如果您的用户难以构建二进制文件，您可能也需要二进制文件。
运行 options(dratBranch="docs"); drat::insertPackage(...) 将这些文件插入您的存储库。
提交更改，并将它们推送到 Github。
在需要使用该非CRAN包的包中，添加
Additional_repositories: https://yourname.github.io/drat
描述。

如果 BOLTSSIRR 更新，

您将负责更新您的存储库。这很好，因为更新可能会破坏您的更新：毕竟，它仍处于开发模式。这也很糟糕，因为您的用户不会自动获得错误修复。

就是这样，如果我没有遗漏任何东西！

使 CRAN R 包建议 GitHub R 包

Make CRAN R package suggest GitHub R package

r

github

cran