Datajoint LabBook - 如何更改端口

Question

我运行 Datajoint LabBook 通过提供的 docker 容器（https://datajoint.github.io/datajoint-labbook/user.html#installation）想知道是否有办法将它从（默认？）端口 (80) 移开？）。我不确定我是否理解 .yaml (docker-compose-deploy.yaml) 中的说明，在我看来有一个 pharus 端点 (5000) 然后有两个端口定义 (443 :443, 80:80) 再往下。我不确定这些指的是什么。

Answer 1

是的，您可以将 DataJoint LabBook 服务移动到不同的端口，但是，需要进行一些更改才能使其正常运行。

TL;DR

假设您在本地访问 DataJoint LabBook，请执行以下步骤：

将行 127.0.0.1 fakeservices.datajoint.io 添加到您的 hosts 文件中。验证 hosts 文件 location in your file system.
将docker-compose-deploy.yaml中的ports配置修改为：

ports:
  - "3000:443" # replace 3000 with the port of your choosing
  #- "80:80" # disables HTTP -> HTTPS redirect

在 Google Chrome 浏览器中导航至 https://fakeservices.datajoint.io:3000

详细说明

让我先谈谈架构，然后描述相关的变化。

下面是文档中提供的 Docker Compose file。我假设您正在尝试在本地运行。

# PHARUS_VERSION=0.1.0 DJLABBOOK_VERSION=0.1.0 docker-compose -f docker-compose-deploy.yaml pull
# PHARUS_VERSION=0.1.0 DJLABBOOK_VERSION=0.1.0 docker-compose -f docker-compose-deploy.yaml up -d
#
# Intended for production deployment.
# Note: You must run both commands above for minimal outage.
# Make sure to add an entry into your /etc/hosts file as `127.0.0.1 fakeservices.datajoint.io`
# This serves as an alias for the domain to resolve locally.
# With this config and the configuration below in NGINX, you should be able to verify it is
# running properly by navigating in your browser to `https://fakeservices.datajoint.io`.
# If you don't update your hosts file, you will still have access at `https://localhost`
# however it should simply display 'Not secure' since the cert will be invalid.
version: "2.4"
x-net: &net
  networks:
      - main
services:
  pharus:
    <<: *net
    image: datajoint/pharus:${PHARUS_VERSION}
    environment:
      - PHARUS_PORT=5000
  fakeservices.datajoint.io:
    <<: *net
    image: datajoint/nginx:v0.0.16
    environment:
      - ADD_zlabbook_TYPE=STATIC
      - ADD_zlabbook_PREFIX=/
      - ADD_pharus_TYPE=REST
      - ADD_pharus_ENDPOINT=pharus:5000
      - ADD_pharus_PREFIX=/api
      - HTTPS_PASSTHRU=TRUE
    entrypoint: sh
    command:
      - -c
      - |
        rm -R /usr/share/nginx/html
        curl -L $$(echo "https://github.com/datajoint/datajoint-labbook/releases/download/\
            ${DJLABBOOK_VERSION}/static-djlabbook-${DJLABBOOK_VERSION}.zip" | tr -d '\n' | \
            tr -d '\t') -o static.zip
        unzip static.zip -d /usr/share/nginx
        mv /usr/share/nginx/build /usr/share/nginx/html
        rm static.zip
        /entrypoint.sh
    ports:
      - "443:443"
      - "80:80"
    depends_on:
      pharus:
        condition: service_healthy
networks:
  main:

首先，上面 header 评论中的 Note 很重要，似乎在 DataJoint LabBook 文档中遗漏了（我已经提交了这个 issue to update it). Make sure to follow the instruction in the Note as 'secure' access is required from pharus （更多关于这个下面）。

在 Docker Compose 文件中，您会注意到 2 个服务：

pharus - DataJoint REST API 后端服务。此服务配置为侦听端口 5000，但是，它实际上并未暴露给主机。这意味着它不会冲突并且不需要任何更改，因为它完全包含在本地虚拟 docker 网络中。
fakeservices.datajoint.io - 暴露给主机的代理服务，因此可以在本地和公共主机上访问。它的主要目的是：

a) 将以 /api 开头的请求转发到 pharus，或

b) 解决对 DataJoint LabBook GUI 的其他请求。

DataJoint LabBook 的 GUI 是一个静态网络应用程序，这意味着它可以作为不安全（HTTP，通常端口 80）和安全（HTTPS，通常端口 443）提供。由于 pharus 的安全要求，为方便起见，对端口 80 的请求被简单地重定向到 443 并公开。因此，如果我们想将 DataJoint LabBook 移动到一个新端口，我们只需将 443 的映射更改为主机上的一个新端口并禁用 80 -> 443 重定向。因此，端口更新将如下所示：

ports:
  - "3000:443" # replace 3000 with the port of your choosing
  #- "80:80" # disables HTTP -> HTTPS redirect

最后，在配置并启动服务后，您应该能够通过在 Google Chrome 浏览器中导航到 https://fakerservices.datajoint.io:3000 来确认端口更改。

Datajoint LabBook - 如何更改端口

Datajoint LabBook - how to change ports

datajoint

TL;DR

详细说明