Python：如何将 While 时间循环代码添加到 EEG CSV 导出中以便更清晰

Question

我目前在使用来自 physio 的 Siena 头皮数据库的脑电图数据时遇到问题。我拥有的脑电图数据有大约 30 个通道和一个在癫痫发作时显示的文本文件。我已经编写了一些代码，将结果导出到具有正确通道名称的 excel 文件中，但我没有时间记录。 [这是我将 EEG 数据导出到 CSV 的代码][1]

导出 EEG 数据的代码

import numpy as np

import mne
 
edf = mne.io.read_raw_edf(r"Path name from external drive\PN00\PN00-1.edf")

np.savetxt('PN00-1Testv2.csv', edf.get_data().T, delimiter=',')

我创建了一个简单的时间代码，但我不知道如何将该代码输入到我当前的代码中。如果有人能帮助我，那就太好了 [这是我的时间循环代码：][2]

时间循环代码

import datetime

import numpy as np

import mne

import pandas as pd

import xlwt

import openpyxl as op


Time_start = datetime.datetime(100,1,1,19,39,33,00) 

Time_increment = datetime.timedelta(milliseconds=0.00195)


x_TimeEnd = datetime.datetime(100,1,1,20,22,58) 


while Time_start <= x_TimeEnd:

    Time_start += datetime.timedelta(milliseconds=0.00195)

    print(Time_start)

以上代码循环直到Time_start小于等于x_TimeEnd。我希望在我的 excel 输出中得到这样的东西，这样对于每条 EEG 数据记录，我都有一个相应的时间输出。

EEG数据的采样率为512Hz EDF 文件中的通道是通道 1：Fp1 通道 2：F3 通道 3：C3 通道 4：P3 通道 5：1 通道 6：F7
通道 7：T3 通道 8：T5 通道 9：Fc1 通道 10：Fc5 通道 11：Cp1
通道 12：Cp5 通道 13：F9 通道 14：Fz 通道 15：Cz 通道 16：Pz
通道 17：Fp2 通道 18：F4 通道 19：C4 通道 20：P4 通道 21：O2
通道 22：F8 通道 23：T4 通道 24：T6 通道 25：Fc2 通道 26：Fc6
通道 27：Cp2 通道 28：Cp6 通道 29：F10 通道 33：EKG 1
频道 34：心电图 2

请原谅任何格式错误，因为这是我第一次使用 Stack Overflow。我已经包含了图像，希望它能 [1]: https://i.stack.imgur.com/O38tF.png [2]: https://i.stack.imgur.com/PnZkg.png

Answer 1

我假设 edf 文件已经有可以使用 mne 模块读取的时间戳。因此，我建议使用它而不是生成新的时间戳。 mne.io.Raw 方法 to_data_frame 将对象转换为 pandas 数据框并允许您指定时间格式。

例如：

import mne
edf = mne.io.read_raw_edf(r"Path name from external drive\PN00\PN00-1.edf")
data = edf.to_data_frame(index="time", time_format="datetime")
data.to_csv("PN00-1Testv3.csv")

“time_format”参数采用 None、“ms”、“datetime”、 或 “timedelta” 作为一个值。有关更多信息，我想推荐阅读文档。

Python：如何将 While 时间循环代码添加到 EEG CSV 导出中以便更清晰

Python: How do I add a While time loop code to a EEG CSV export for better clarity

python

time

while-loop

european-data-format

导出 EEG 数据的代码

时间循环代码