将新列添加到函数内的 data.table 引用并不总是有效

Question

在编写依赖于 data.table 的程序包时，我发现了一些奇怪的行为。我有一个函数可以通过引用删除和重新排序一些列，它工作得很好，这意味着我传入的 data.table 被修改而没有分配函数输出。我有另一个添加 new 列的函数，但是这些更改并不总是保留在传入的 data.table 中。

这是一个小例子：

library(data.table)  # I'm using 1.9.4
test <- data.table(id = letters[1:2], val=1:2)
foobar <- function(dt, col) {
    dt[, (col) := 1]
    invisible(dt)
}

test
#  id val
#1: a   1
#2: b   2
saveRDS(test, "test.rds")
test2 <- readRDS("test.rds")
all.equal(test, test2)
#[1] TRUE
foobar(test, "new")
test
#  id val new
#1: a   1   1
#2: b   2   1
foobar(test2, "new")
test2
#  id val
#1: a   1
#2: b   2

发生了什么事？ test2有什么不同？我可以就地修改现有列：

foobar(test, "val")
test
#  id val new
#1: a   1   1
#2: b   1   1
foobar(test2, "val")
test2
#  id val
#1: a   1
#2: b   1

但是添加到test2还是不行：

foobar(test2, "someothercol")
.Last.value
#  id val someothercol
#1: a   1            1
#2: b   1            1
test2
#  id val
#1: a   1
#2: b   1

我无法确定我看到此行为的所有情况，但保存到 RDS 和从 RDS 读取是我可以可靠复制的第一个情况。写入和读取 CSV 似乎没有相同的问题。

这是一个指针问题吗 this issue，就像序列化一个 data.table 会破坏过度分配的指针一样？有没有简单的方法来恢复它们？我如何在我的函数中检查它们，以便在操作无法正常工作时恢复指针或错误？

我知道我可以将函数输出分配为解决方法，但这不是很 data.table-y。那不也会在内存中创建一个临时副本吗？

对阿伦解决方案的回应

Arun 说明确实是指针问题，可以用truelength 诊断，用setDT 或alloc.col 修复。我运行遇到了一个问题，将他的解决方案封装在一个函数中（从上面的代码继续）：

func <- function(dt) {if (!truelength(dt)) setDT(dt)}
func2 <- function(dt) {if (!truelength(dt)) alloc.col(dt)}
test2 <- readRDS("test.rds")
truelength(test2)
#[1] 0
truelength(func(test2))
#[1] 100
truelength(test2)
#[1] 0
truelength(func2(test2))
#[1] 100
truelength(test2)
#[1] 0

所以看起来函数内部的本地副本被正确修改了，但参考版本没有。为什么不呢？

Answer 1

Is this a pointer issue ala this issue, like serializing a data.table destroys the over-allocated pointers?

是，从磁盘加载会将外部指针设置为 NULL。我们将不得不再次过度分配。

Is there a simple way to restore them?

是的。您可以测试 data.table 的 truelength()，如果是 0，则在其上使用 setDT() 或 alloc.col()。

truelength(test2) # [1] 0
if (!truelength(test2))
    setDT(test2)
truelength(test2) # [1] 100

foobar(test2, "new")
test2[]
#    id val new
# 1:  a   1   1
# 2:  b   2   1

~~这应该作为常见问题解答（不记得在那里看到过）。~~
已在警告消息部分的 FAQ 中。

将新列添加到函数内的 data.table 引用并不总是有效

Adding new columns to a data.table by-reference within a function not always working

r

data.table

对阿伦解决方案的回应