glmmTMB 的每个模型都有警告 'giveCsparse'

Question

我在 R markdown 文档中使用 glmmTMB 库运行混合模型。我运行的任何模型都会收到以下警告：

'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

然后，如果我运行控制台中的代码，我会收到这些警告：

Warning messages:
1: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
2: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
3: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

我的代码如下所示：

m1 <- glmmTMB(count~var1+var2+var3+(1|group), data = bd, family = "poisson")

我尝试使用 dependencies=TRUE 重新安装 TMB 和 glmmTMB，但该消息一直出现。显然它根本不会影响模型，但无论我做什么测试或图表，我都会不断收到警告。有可能解决这个问题吗？还是我直接忽略它？

Answer 1

这是无害的。您可以：

从 CRAN 安装最新版本 glmmTMB（目前为 1.1.2）。
无视
使用suppressWarnings()（可能会丢失其他相关警告！）
install the development version from GitHub, where it was fixed in this commit。（现在存储库中的二进制包也已更新。）

或者您可以将您的 Matrix 版本降级 到旧版本（使用 remotes::install_version() 或 snapshot 包）

glmmTMB 的每个模型都有警告 'giveCsparse'

Warning in every model of glmmTMB 'giveCsparse'

r

warnings

glmmtmb