从 Grakn 导出关联矩阵的方法？

Question

我们经常使用GraphBLAS for graph processing so we need to use the incidence matrix。我一直无法找到将其从 Grakn 导出到 csv 或任何文件的方法。这可能吗？

Answer 1

目前在 Grakn 中没有将数据转储到 CSV 的内置方法。但是，我们非常鼓励我们的社区为此类任务贡献开源工具！欢迎在我们的 discord.

上讨论使用它

至于如何实现，从概念上讲很简单：

查询以流出所有超关系：

match $r isa relation;

然后对于每个关系，我们可以通过管道传输另一个查询（如果您希望保持较低的内存使用率，可能在新事务中）：

match $r iid <iid of $r from previous query>; $r ($x); get $x;

这将使你在这个特定的超关系中发挥作用$r的一切。

如果您还希望提取附加到超关系的属性，您可以使用以下方法

match $r iid <iid of $r from first query>; $r has $a; get $a;

实际上我们可以使用这些步骤来构建 A 关联矩阵中的每一列。

我应该提出一些重要的警告：

你最终得到的结果将排除所有关于超级关系的类型信息、关系中的角色扮演者以及由超级关系扮演的实际角色角色扮演者，以及拥有的属性类型。

==> hear/discuss 如何编码类型信息以便在 GraphBLAS 中使用会很有趣

在 Graql 中，关系参与关系是完全可能的。在最坏的情况下，这意味着所有超边 E 也将出现在集合 V 中。实际上只有少数关系会在其他关系中发挥作用，因此只有 E 的子集可能在 V.

Answer 2

所以关联矩阵相当于力图可视化中使用的nodes/edges数组。在这种情况下，它非常简单。

我的方法与上面的略有不同，因为我需要做的就是拉取数据库中的所有内容（实体、关系、属性），

match $ting isa thing;

现在，当我收回我的交易时，对于每个 $ting，如果我正在构建一个力图即，我想使用本地和远程方法提取所有可用的属性，但是对于您的关联矩阵，我真的只关心拉取 3 位数据：

事物的 iid
事物可能拥有的属性。
事物拥有的角色，如果它是一个关系

本质上是测试每个返回的对象以找出类型（例如实体、属性、关系），然后使用一些本地和远程方法来获取所需的数据。在 Python 中，为关系提取数据的代码类似于

# pull relation data
        elif thing.is_relation():
            rel = {}
            rel['type'] = 'relation'
            rel['symbol'] = key
            rel['G_id'] = thing.get_iid()
            rel['G_name'] = thing.get_type().get_label().name()
            att_obj = thing.as_remote(r_tx).get_has()
            att = []
            for a in att_obj:
                att.append(a.get_iid())

            rel['has'] = att
            links = thing.as_remote(r_tx).get_players_by_role_type()
            logger.debug(f' links are -> {links}')
            edges = {}
            for edge_key, edge_thing in links.items():
                logger.debug(f' edge key is -> {edge_key}')
                logger.debug(f' edge_thing is -> {list(edge_thing)}')
                edges[edge_key.get_label().name()] = [e.get_iid() for e in list(edge_thing)]

            rel['edges'] = edges
            res.append(rel)
            layer.append(rel)
            logger.debug(f'rel -> {rel}')

然后这给了我们一个节点数组，我们可以很容易地处理它来构建一个边缘数组（即连接一个对象和它拥有的属性的链接，或者连接一个关系到它的角色参与者的链接）。因此，导出关联矩阵非常简单

从 Grakn 导出关联矩阵的方法？

Method to export Incidence Matrix from Grakn?

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