使用 pynco 包压缩 netCDF 文件

Question

我有兴趣使用 pynco 包在 python 中压缩 NetCDF 文件。在命令行中，我通常会使用：

nccopy -d 3 input_file.nc output_file.nc

在 python 中，我尝试了以下方法：

from nco import Nco
Nco.nccopy(input='input_file.nc', output='output_file.nc', options=['-d 1'])

这会产生属性错误 'Nco' has no attribute 'nccopy'。 pynco 是否支持 nccopy？

Answer 1

nccopy 是 netCDF 命令，不是 NCO 命令。然而，ncks 几乎可以做 nccopy 能做的所有事情，还有很多其他的事情。要按照您的示例进行压缩，请尝试

Nco.ncks(input='input_file.nc', output='output_file.nc', options=['-7 -L 1'])

Answer 2

只是为了列出 pynco 的替代方案，您也可以在 python 内使用 cdo 包进行此操作：

from cdo import *
cdo = Cdo()
cdo.copy(input='input.nc',output='output.nc',options='-f nc4 -z zip_7')

您可以选择从轻 (zip_1) 一直到最压缩 (zip_9) 的压缩级别，我通常发现超过级别 4 或 5 并没有太多增益（即额外的尺寸节省非常小）带来很多痛苦（命令需要更长的时间！）。我认为如果输入是 netCDF4 标准，可能不需要 -f nc4 来确保 netCDF4 输出，但无论如何放它也无妨。

你可以用

安装cdo

pip3 install cdo

使用 pynco 包压缩 netCDF 文件

Compressing a netCDF file with the pynco package

python-3.x

nco

pynco