如何在没有图像偏移的情况下在 pydicom 中读取然后写入多帧 DICOM 文件？

Question

我用pydicom读了一个多帧DICOM文件，然后我把它写入一个新文件。但是，当我打开 DICOM 文件时，图像有一个 offset/shift.

ds = pydicom.dcmread('./Multiframe/0020.dcm')
arr  = ds.pixel_array
ds.PixelData = encapsulate([arr[0].tobytes(),
                            arr[1].tobytes(),                 
                            arr[2].tobytes(),
                            arr[3].tobytes(),
                            arr[4].tobytes(),
                            arr[5].tobytes(),
                            arr[6].tobytes(),
                            arr[7].tobytes(),
                            arr[8].tobytes(),
                            arr[9].tobytes(),
                            arr[10].tobytes()])

ds.save_as('new.dcm', write_like_original=False)

代码有什么问题？如果我写一个简单的图像（不是多帧）它就可以工作，问题在于封装。

原文：

之后：

Answer 1

Encapsulation of Pixel Data（单帧和多帧）仅在压缩传输语法中需要，例如 JPEG 或 RLE Lossless。如果您有未压缩的语法，例如 Explicit VR Little Endian，则不需要封装：

ds = pydicom.dcmread('./Multiframe/0020.dcm')
arr  = ds.pixel_array
if ds.file_meta.TransferSyntaxUID.is_compressed:
    raise AttributeError("Encapsulation required for compressed transfer syntaxes")

ds.PixelData = arr.tobytes()
ds.save_as('new.dcm', write_like_original=False)

如何在没有图像偏移的情况下在 pydicom 中读取然后写入多帧 DICOM 文件？

How do I read and then write a multi-frame DICOM file in pydicom without an image offset?

python

dicom

pydicom