计算 TP、FP、TN、FN 值

Question

我正在尝试构建一个非常简单的程序来计算 2 个字符串的 TP/FP/FN/TN（预测的二级蛋白质结构与已证实的二级蛋白质结构），但它没有正确计算它们。我缺少什么？

actual_str = '*ΟΟΟΟΟΟ******////////////**//////////*****////ΟΟΟΟΟΟΟΟΟ***'
predicted_str = '****--********/////////-----//////****----**-ΟΟΟΟΟΟΟ/-****'

TP = 0
FP = 0
TN = 0
FN = 0

for i in range(len(predicted_str)): 
    if predicted_str[i]==actual_str[i]=='O':
        TP += 1
        
    if predicted_str[i]!='O' and actual_str[i]=='O': 
        FP += 1
        
    if predicted_str[i]==actual_str[i]=='/' or predicted_str[i]==actual_str[i]=='*':
        TN += 1
        
    if predicted_str[i]=='O' and actual_str[i]!='O':
        FN += 1
        
    if predicted_str[i]=='-': #just ignore the '-' and move on to the next
        i+=1

print(TP, FP, TN, FN)

输出：0 0 26 0

Answer 1

这很奇怪，但请尝试复制 actual_str 或 predicted_str 变量中使用的 'O' 字符之一，并将其粘贴到您的 if 语句中。我认为存在不匹配，即使它们看起来相同。

最后一个 if 语句也不是必需的。

Answer 2

如前所述，您使用的字符不同，它混合了希腊字母 O omicron 和拉丁字母 o 大写。

https://apps.timwhitlock.info/unicode/inspect?s=%CE%9F

此外，在这个用例中使用 zip 运算符而不是按索引比较它是有意义的：

for (actual, predicted) in zip(actual_str, predicted_str):
   if (..

计算 TP、FP、TN、FN 值

Calculating TP, FP, TN, FN values

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