使用 network_plot 可视化 R 中的相关矩阵

Question

我想可视化 60 多个属性的相关矩阵。我试过 'library(corrplot)'，结果显示警告：“太多重叠”。然后我试了一下，显示了一个乱七八糟的图，标签太大，曲线重叠。

library(corrr)
data %>% correlate() %>% network_plot(min_cor = 0.4)

我尝试按照https://www.rdocumentation.org/packages/memnet/versions/0.1.0/topics/network_plot调整标签大小和曲线宽度，它显示错误：

Error in network_plot(correlate(data), min_cor = 0.4, nod_cex = 2, : unused arguments (nod_cex = 2, lab_cex = 1, lab_lwd = 2)

Answer 1

memnet 是一个已弃用的包，已从 CRAN 中删除，所以这是正常的，您不能使用此包中的 network_plot，但在这里您使用的是 network_plot来自 corrr 包的函数没有相同的参数：https://www.rdocumentation.org/packages/corrr/versions/0.4.3/topics/network_plot

有 60 个变量，我认为 network_plot 不是可视化的最佳选择。但是，您可以尝试使用 corrplot 如下：

#Create a data frame with random values
df=data.frame(replicate(60,sample(0:60,10,rep=TRUE)))
cor=cor(df)
cor2 <- corrplot::corrMatOrder(cor, order = "FPC", hclust.method = "average")
corrplot::corrplot(cor[cor2,cor2], diag = F, type = "lower",
                       method = "color",  mar = c(1,1,3,1), tl.srt = 60, tl.cex = 0.4)

这将生成更易于解释的图表：

使用 network_plot 可视化 R 中的相关矩阵

Use network_plot to visualise correlation matrix in R

r

networking

visualization

correlation