Cytoscape 中具有相对距离的细胞邻域分析
Cell neighborhood analysis with relative distances in Cytoscape
是否可以在 cytoscape 中通过定义的分数显示具有相对距离的邻域分析？例如：2=不在直接邻域内，1=在直接邻域内，0=随机排列。
取更大的值是很好的，我也会在我的分析中实现这一点。不幸的是，我仍然不清楚应该使用哪种方法来可视化相对距离。根据我的阅读，“力导向”范式应该是我分析的最佳解决方案。有人同意吗？
提前致谢并致以最诚挚的问候 Joschua
当然，您当然可以这样做。真正的问题是您希望网络看起来像什么？如果您试图通过使用您的相对距离来查看某种聚类效应，我会使用不同的数字——可能 100=不在直接邻域内，1=在直接邻域内，空白表示随机排列。如果您想将相对距离用于其他用途（例如边缘类型或颜色），则缩放比例无关紧要。
-- 滑板车
是否可以在 cytoscape 中通过定义的分数显示具有相对距离的邻域分析？例如：2=不在直接邻域内，1=在直接邻域内，0=随机排列。
取更大的值是很好的，我也会在我的分析中实现这一点。不幸的是，我仍然不清楚应该使用哪种方法来可视化相对距离。根据我的阅读，“力导向”范式应该是我分析的最佳解决方案。有人同意吗？ 提前致谢并致以最诚挚的问候 Joschua
当然，您当然可以这样做。真正的问题是您希望网络看起来像什么？如果您试图通过使用您的相对距离来查看某种聚类效应，我会使用不同的数字——可能 100=不在直接邻域内，1=在直接邻域内，空白表示随机排列。如果您想将相对距离用于其他用途（例如边缘类型或颜色），则缩放比例无关紧要。 -- 滑板车