由于 getNodeSet {XML} 错误，biomaRt getBM 无法正常工作

Question

我在 r 中运行以下代码，但无法正常工作。 getBM 似乎不适用于任何参数。我做错了什么吗？

ibrary(biomaRt)

ensembl <- useEnsembl(biomart = "genes")
ensembl <- useEnsembl(biomart = "ensembl", 
                       dataset = "hsapiens_gene_ensembl", 
                       mirror = "useast")
affyids <- c("202763_at","209310_s_at","207500_at")
getBM(attributes = c('affy_hg_u133_plus_2', 'entrezgene_id'),
       filters = 'affy_hg_u133_plus_2',
       values = affyids, 
       mart = ensembl)

我得到的错误是 Error in getNodeSet(html, path = "//div[@class='plain-box float-right archive-box']")[[1]] : subscript out of bounds 我在 r 版本 3.6.3 和 4.1

中都试过了

Answer 1

根据 https://www.ensembl.org/info/，Ensembl 暂时不可用。

由于 getNodeSet {XML} 错误，biomaRt getBM 无法正常工作

biomaRt getBM not working due to getNodeSet {XML} error

xml

r

biomart