根据 bash 脚本中的名称有选择地创建文件夹

Selectively create folders based on names in bash script

我有几个文件如下:

dosulepin3D_CID_5284550.pdbqt
protriptyline3D_CID_4976.pdbqt

这些是小分子。现在我想在 Results 文件夹中为这些分子中的每一个创建一个文件,忽略它们后面的 3D_CID_5284550.pdbqt,并有一个名为的文件夹:

dosulepin
protriptyline

我想使用 for 循环执行此操作,因为我还对这些文件执行了一些功能。这是我的:

DIR="/home/roy/MolecularDocking/VirtualScreening/Dockings"
cd $DIR
for ligand in ligands/*; do
    echo $ligand
    mkdir "/home/roy/MolecularDocking/Results/$ligand"
done;

但这显然会创建具有全名的文件夹。

像这样。

DIR="/home/roy/MolecularDocking/VirtualScreening/Dockings"
cd "$DIR" || exit

for ligand in ligands/*.pdbqt; do
    echo "$ligand"
    echo mkdir -p "/home/roy/MolecularDocking/Results/${ligand%3D*}"
done

如果您对输出感到满意,请从 mkdir 中删除 echo

有关详细信息,请参阅 Parameter Expansion