ggplot2 中的蠕虫图残差图
Worm plot residuals graph in ggplot2
我正在尝试在使用 gamlss
包中的 gamlss
函数拟合的模型上绘制蠕虫图残差。兴趣图如下所示:
最初,下面是参考使用childsds
包中的wormplot_gg
函数的计算例程,但是,使用上述函数表示的结果与示例所示不同上面,它被应用于 R 中包含的数据集。
library(ggplot2)
library(gamlss)
library(childsds)
head(Orange)
Dados <- Orange
Model <- gamlss(circumference~age, family=NO,data=Dados); Model
wp(Model)
wormplot_gg(m = Model)
下面是 gamlss
包中 wp
函数的传统结果。
最后,我们通过 childsds
包中的 wormplot_gg
函数获得了结果。然而,正如已经描述的那样,这个并没有以我感兴趣的方式呈现,即第一个图的视觉结构。
使用带有 detrend=True
选项的 qqplotr https://aloy.github.io/qqplotr/index.html
library(qqplotr)
set.seed(1)
df <- data.frame(z=rnorm(50))
ggplot(df, aes(sample=z)) +
stat_qq_point(detrend = T) +
stat_qq_band(detrend = T, color='black', fill=NA, size=0.5)
您还可以添加geom_hline(yintercept = 0)
编辑:
在将其与 gamlss 模型一起使用的情况下,首先必须从模型中提取随机化残差,对于 gamlss,这只需使用函数 residuals
即可完成,因此您只需执行例如 df <- data.frame(z=residuals(Model))
然后继续剩下的代码
我正在尝试在使用 gamlss
包中的 gamlss
函数拟合的模型上绘制蠕虫图残差。兴趣图如下所示:
最初,下面是参考使用childsds
包中的wormplot_gg
函数的计算例程,但是,使用上述函数表示的结果与示例所示不同上面,它被应用于 R 中包含的数据集。
library(ggplot2)
library(gamlss)
library(childsds)
head(Orange)
Dados <- Orange
Model <- gamlss(circumference~age, family=NO,data=Dados); Model
wp(Model)
wormplot_gg(m = Model)
下面是 gamlss
包中 wp
函数的传统结果。
最后,我们通过 childsds
包中的 wormplot_gg
函数获得了结果。然而,正如已经描述的那样,这个并没有以我感兴趣的方式呈现,即第一个图的视觉结构。
使用带有 detrend=True
选项的 qqplotr https://aloy.github.io/qqplotr/index.html
library(qqplotr)
set.seed(1)
df <- data.frame(z=rnorm(50))
ggplot(df, aes(sample=z)) +
stat_qq_point(detrend = T) +
stat_qq_band(detrend = T, color='black', fill=NA, size=0.5)
您还可以添加geom_hline(yintercept = 0)
编辑:
在将其与 gamlss 模型一起使用的情况下,首先必须从模型中提取随机化残差,对于 gamlss,这只需使用函数 residuals
即可完成,因此您只需执行例如 df <- data.frame(z=residuals(Model))
然后继续剩下的代码