机器学习算法的 Flink HBase 输入

Question

我想使用 Flink-HBase 插件读取数据，然后作为 Flink 机器学习算法（分别为 SVM 和 MLR）的输入。现在我先把提取出来的数据写到一个临时文件中，然后通过libSVM的方法读入，但我想应该有更复杂的方法。

您有代码片段或想法吗？

Answer 1

无需将数据写入磁盘再用MLUtils.readLibSVM读取。原因如下。

MLUtils.readLibSVM 需要一个文本文件，其中每一行都是具有相关标签的稀疏特征向量。它使用以下格式表示标签-特征向量对：

<line> .=. <label> <feature>:<value> <feature>:<value> ... <feature>:<value> # <info>

其中<feature>是后面value在特征向量中的索引。 MLUtils.readLibSVM 可以读取这种格式的文件并在 LabeledVector 实例中转换每一行。因此，您在读取 libSVM 文件后获得 DataSet[LabeledVector]。这正是 SVM 和 MultipleLinearRegression 预测器所需的输入格式。

但是，根据您从 HBase 获取的数据格式，您首先必须将数据转换为 libSVM 格式。否则，MLUtils.readLibSVM 将无法读取写入的文件。而如果你转换数据，那么你也可以直接将你的数据转换成一个 DataSet[LabeledVector] 并作为 Flink 的 ML 算法的输入。这避免了不必要的磁盘循环。

如果您从 HBase 获得一个 DataSet[String]，其中每个字符串都具有 libSVM 格式（请参阅上面的规范），那么您可以在 HBase DataSet 具有以下地图功能。

val hbaseInput: DataSet[String] = ...
val labelCOODS = hbaseInput.flatMap {
  line =>
    // remove all comments which start with a '#'
    val commentFreeLine = line.takeWhile(_ != '#').trim

    if(commentFreeLine.nonEmpty) {
      val splits = commentFreeLine.split(' ')
      val label = splits.head.toDouble
      val sparseFeatures = splits.tail
      val coos = sparseFeatures.map {
        str =>
          val pair = str.split(':')
          require(
            pair.length == 2, 
            "Each feature entry has to have the form <feature>:<value>")

          // libSVM index is 1-based, but we expect it to be 0-based
          val index = pair(0).toInt - 1
          val value = pair(1).toDouble

          (index, value)
      }

      Some((label, coos))
    } else {
      None
    }

// Calculate maximum dimension of vectors
val dimensionDS = labelCOODS.map {
  labelCOO =>
    labelCOO._2.map( _._1 + 1 ).max
}.reduce(scala.math.max(_, _))

val labeledVectors: DataSet[LabeledVector] = 
  labelCOODS.map{ new RichMapFunction[(Double, Array[(Int, Double)]), LabeledVector] {
  var dimension = 0

  override def open(configuration: Configuration): Unit = {
    dimension = getRuntimeContext.getBroadcastVariable(DIMENSION).get(0)
  }

  override def map(value: (Double, Array[(Int, Double)])): LabeledVector = {
    new LabeledVector(value._1, SparseVector.fromCOO(dimension, value._2))
  }
}}.withBroadcastSet(dimensionDS, DIMENSION)

这会将你的libSVM格式数据转换成LabeledVectors的数据集。

机器学习算法的 Flink HBase 输入

Flink HBase input for machine learning algorithms

hbase

machine-learning

apache-flink